Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_145689.3
Sequence Length
2658 nt
GC Content
0.6114
CUUCCCCGCGCGGCCGCGGCGCCGCACAGCCGCCGCCAUUCGGGCUCCAGCCCCGUCCGCGCGUCUCCCGGCGUGGGUGCGGGACCAGGGCGCUGCGGGGCGCGCAGGGAGCUGCCAAGGCCAUGUCUGUUCCAUCAUCACUGAGCCAGUCGGCCAUUAAUGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACUGAGCCUACCCCUGCCUCUGCACGCUGCCCACAACCAGCUGCUCAACGCCAAGCUGCAGGCCACAGCUGUGGGACCCAAGGACCUGCGCAGCGCCAUGGGGGAGGGUGGUGGGCCUGAGCCAGGCCCUGCCAAUGCCAAGUGGCUAAAAGAGGGCCAGAACCAGCUCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGUGACCAGAAUCGCAAUGUGACCUUGACCUUGGCGGAGGAGGCCAGCCAGGAGCCUGAGAUGGCACCCUUGGGCCCCAAAGGCCUGAUACACCUGUACUCUGAGCUGGAGCUCUCAGCUCACAACGCAGCCAACCGAGGCCUACGAGGACCUGGCCUGAUCAUCAGCACUCAAGAGCAGGGGCCAGAUGAGGGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGAUGAUGAUGAUGAAGAGGAGGAGGAGGACUUAUCUUCUCCCCCAGGGCUGCCUGAGCCCCUGGAGAGUGUGGAGGCCCCUCCCAGGCCCCAAGCCCUUACAGAUGGCCCCCGGGAACACAGCAAGAGUGCCAGCCUCCUGUUUGGCAUGCGGAACAGUGCAGCCAGUGAUGAGGACUCAAGCUGGGCUACCUUAUCCCAGGGCAGCCCCUCCUAUGGCUCCCCAGAGGACACAGAUUCCUUCUGGAACCCCAACGCCUUCGAGACGGAUUCCGACCUGCCGGCUGGAUGGAUGAGGGUCCAGGACACCUCAGGGACCUAUUACUGGCACAUCCCAACAGGGACCACCCAGUGGGAACCCCCCGGCCGGGCCUCCCCCUCACAGGGGAGCAGCCCCCAAGAGGAGUCCCAGCUCACCUGGACAGGUUUUGCUCAUGGAGAAGGCUUUGAGGAUGGAGAAUUUUGGAAGGAUGAACCCAGUGAUGAGGCCCCAAUGGAGCUGGGACUGAAGGAACCUGAGGAGGGGACGUUGACCUUCCCAGCUCAGAGCCUCAGCCCAGAGCCGUUGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCUUCCCCCACGGAAUACCAACCCAGGGAUCAAGUGUUUCGCCGUGCGCUCCCUAGGCUGGGUAGAGAUGACCGAGGAGGAGCUGGCCCCUGGACGCAGCAGUGUGGCAGUCAACAAUUGCAUCCGUCAGCUCUCUUACCACAAAAACAACCUGCAUGACCCCAUGUCUGGGGGCUGGGGGGAAGGAAAGGAUCUGCUACUGCAGCUGGAGGAUGAGACACUAAAGCUAGUGGAGCCACAGAGCCAGGCACUGCUGCACGCCCAACCCAUCAUCAGCAUCCGCGUGUGGGGCGUCGGGCGGGACAGUGGAAGGGACUUUGCCUACGUAGCUCGUGAUAAGCUGACCCAGAUGCUCAAGUGCCACGUGUUUCGCUGUGAGGCACCUGCCAAGAACAUCGCCACCAGCCUGCAUGAGAUCUGCUCUAAGAUCAUGGCCGAACGGCGUAAUGCCCGCUGCUUGGUAAAUGGACUCUCCCUGGACCACUCUAAACUUGUGGAUGUCCCUUUCCAAGUGGAAUUCCCAGCGCCUAAGAAUGAGUUGGUCCAGAAGUUCCAAGUCUAUUACCUGGGGAAUGUACCUGUUGCUAAACCUGUUGGGGUAGAUGUGAUUAAUGGGGCCCUCGAGUCAGUCCUGUCCUCCAGCAGCCGUGAACAAUGGACCCCAAGUCAUGUCAGUGUGGCCCCUGCUACCCUCACCAUCUUGCACCAGCAGACAGAGGCAGUGCUGGGAGAGUGUCGGGUGCGUUUCCUCUCCUUCCUGGCCGUGGGCAGAGAUGUCCACACGUUUGCAUUCAUCAUGGCUGCCGGCCCAGCCUCCUUCUGCUGCCACAUGUUCUGGUGCGAGCCCAAUGCUGCCAGCCUCUCAGAGGCUGUGCAGGCUGCGUGCAUGCUUCGCUACCAGAAGUGUCUGGAUGCCCGUUCCCAGGCCUCCACCUCCUGCCUCCCAGCACCCCCUGCUGAGUCUGUGGCACGGCGUGUAGGGUGGACUGUCCGCAGGGGUGUUCAGUCGCUGUGGGGCUCCCUGAAGCCCAAACGGCUGGGGGCCCAUACCCCAUGAAGAAGCCCCCACCUUCCCUCCACCUGCUUGUGUUGGGCCCCAGGGAACUAAAGGGUGUGGGUCAGGGAGGGGUCUAGAGGCUAUUCCUAGGCCUCAGGCCUCCCAAAUAUGCCCCUCCCCAGUAGCUACGGUUCCCUGCCUAGGAGCUGGGGAGGGAGAGAUCUAAUCCCUUCAAGGAAGUGAUAACACUGGAGUGGUAACAAGAGGAGCAGGAAGCAAGGCCAGCCCUGGUUCUCCAUCCCCAUGUGUUUCAGGUGGAACAGGAGGAACUGGUCCAGGCCAGGCCUCAUCCUCCUGGACCCAGCAGGGGCAGAAGGAGGAAGGGACUGGUCCAGGCAUGGGUCCCUUCCCCCUGCUCCAUGGGCACCUCUGCUGUAUUGAUAUCACUAAUAAAGUCUGUCUGCACUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1142.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1185.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 775.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((.(((((........))))).)))....((((....))))...((((((........)))))))))))))((((((((.(((((.....)))))((.....))..((((.((((((((((.((((((((...(((((.(((.......))).............((((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((..(((((((.....))..)))))..(((....((((((((.((...)).))..)))))))))..(((((.(((.((((((((((.....((((((......(((....)))......)))))).((((..(((((((.((((((((((((....)))))((((((((....(((((.(.........((((((((((((..(((.(.(((((((((..(((...(((((((.....))))))).....((((....((((((((.....))))))))....))))....((.((((((...))).)))))((((.((............)).))))((((((..((((((((((((((((((...((((.(((((((((((.((......................((.((((((((.....)))))))).)).(((((.....)))))((((((.((.(((.((((.......))))))).)).))).)))...((((..((((...((((..((((.....((((....(((((.((((......)))))))))....))))))))..))))..........)))).))))..)))))))).)))))..((((((((.......))).)))))..))))..)))))))..((((.((.(((((((..(.((.((((((.(((((((.((((.(((((..(((.(((((((((((..(((((.....(((....))).((.((......)).)).((((((((((......))))))..))))((((((....(((...((((.......(((((((.(((...))))))))))))))...)))...))))))..)))))...)))))))).))))))((((((..(((((.((((.((...(((((..(((((........)))))..)))))..)))))))))))..))))))((((((.(((.((.(((((....(((..((........))..))).......))))).))(((((.((((((((((.(((.......))).))(((((((((((....(((.((((...(((........))).)))).))))))))))).)))................(((((....))))).((.(((((((((.((.(....((...((((.(.(((((.((((.(((.(.((((..(((...(((((((((.((((.((((((((((((.(((((.((((.((((..((....))..)))))).)).))))).).)))))).........))))).....)))))))....)))...)))...)))..)))).).))).)))))))))).))))....)).....).)).)).))))))).))...(((((......)))))...(((((.(((((.......))))).))))).((((((((((..(((((((((((....((((.((.(((....((((....))))......)))))))))...))).)))))))).)).....)))))))).)))))))).)))))...........))).))))))..(((((((((..(((((.((.....(((...((((......))))...))).....)).)))))))))))))))).)))...))))..))))))))))))).)).((((((...........)))))))..)).))))))).)))))))))))))))))))))(((((((....))))))).....)))..)).))).)))).).)))...)))))).))))))).)))))))))))))))).))))....(((((((((((...))))))).))))((.....))(((((((.......)))))))))))).))..)))).)))))..))))).))).)))))(((((.....)))))....)))))..)))))))))))).(((...))))))))))))))))))....)))))))((((((..((((((..((.(((((((.................))))))))).......(((......)))))))))..))))))....(((((..((((((..((.(((((((.((((((.......)))))))))))))))........(((((((((((..(((.(((.....))))))..)))))))))))...))))))..))))).......((....))))))))))))).....)))))))))...))).)))).))))))))(((((....((((.((...)).))))....)))))....((((((((..(((......)))))))))))(((((((((....(((.((((((((((.((......)).)))))))))).)))((((...)))).)))))))))....((((..(((.....))).))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{(((,(((((,(((((((({{.....|||||.|||....{|||....))||,,,{(((((........)))))))}))))}....,)))))}))}}}.))))).)}}}|,,{{...((((.((((((((((.(({,,,,{|.{(({{{,(((.......}}}....|,{,.,,.{((((((((((((((..((((((((((((((((((((.(((((,,(((((((.....)}..)))))..(((....((((((((.((...)).))}.}))))))))..((((({((({(({(((((((.....((((((......(((....)))......)))))).((((..(((((((.((((((...)))))).))).}|{(((,.{{{{.,,|||,..........((((((((((((..(((.(,(((((((((..(((...{{(((((.....))))}},....{((((.,{,((((((((,,,..,})))))}....}}}|,,...,.||||||...,)).)))))|{((..,..,,}...,,.,)}}))))((((((..(((((((((({(((((((...((((.(((((((((((.({.,{.,,................((.(((((((,.....}))))))),)}.(((((.....)))))((((((.((.(((.((((.......))))))).)).))}.)))..|{{{{,.{({{...{(((..((((.....((((....(((((.((((......)))))))))....))))))))..))))||,,.}},..)))).)))}.,)))))))).)))))..((((((((.......)))}}))))..))))..))))))).,((((.(,{(((((((.,(.((.((((((.(((((((.((((,({(({,,(((.(((((((((((..(((((,.,({(((....}}}.{{(((..,{{|||{{,.((((((((((......))))))..))))||,.|.}|.||||},,|||,{{{,|,.{((((((.(((..,}}}}})})}}},})|.,}}},..,,})}}..)))))...)))))))),}))}))|(((((..(((((.((({,((...(((((..(((((.,....,.)))))..)))))..)))))))))))..))))}|((((((.(((.((,{.,{{||||{{{.,((..,,,,..||{{|||....,{(((|||,{{,.{{{|{{(|{{{({{{({{...{{{{,||.{|(,(({{{{{{|}}}}||,.(((({,{((({{{..,..,,..}}}|{|||,||||||}||||.||..........{{{,((,{.{{{||,,,.}))))|}}}|}))|..||..,||,,,(((...,||||||||.|||||.,.((((,.,{{|||||{.{{,,,,{{|||,.||||||||||.{((((.{({(.||{|,.((....)).})})))).)).)))))}}}))})}}..{|,.|||}}})},.,|||||||||....|||{...,,{{{|,|{.,|||,|{,||{||||},,,})}))))).}}})..},.)})).},.})))),)}))}}}|{(((......)))))...((({{.{|||{.....,,))))).})))).{(((((((,{..(((((((((((....((((,(({..({{{{(,,,,}}.)))..}}}..},},,,}))...))),,))))))).}).....)))))))).))})))},.,}},}},,,.......))).))))))).(((((((({..(((((,({.....(((...((((......))))...))).....)).)))))})))))))),},))),..))))..))))))))))))).)).((((((...........))))))}..)).))))))).)))))))))))))))))))))(((((((....))))))).....)))..)).))).)))).),)))...))))))}})))))}.}||||.{((((((((((((.,.,,((((((((((((...))))))).)))},,.,}})}...))}}))).))))))}))))}})),.))..)))).)))))),))))),))).))))}(((((.....))))).},.)))))..)))))))))))).(((...)))))))))))))))))}...,)))))))|{|{{{..((({{,..|||(((((((...,.......,.....)))))))||,,.....{,{..||..}}}}})))}..})))),.,,.(((((..((((((.{((,(((((((.((((((.......)))))))))))))))........(((((((((((..(((.(((.....))))))..)))))))))))...))))))..)))))...,..{(({....))))|}}|}}}}.....}||||}|||,..|}}.}}}}.||||}|{|{((((.{{{(({(,{{...)),)}))}...))}}}}.||((((((((..{((......)))))))))))|||{{((((|||..((.((((((((((.({......)).)))))))))),)))||||}..)))).))}))))}},...({{{..{{{.....})).)))).)),..,.
Back