Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0003200
Sequence Length
1530 nt
GC Content
0.4072
AUAUCCCUGAUCAAGUUAUAAGAGUUUUCAAAGUGGAUCAGCAAAGUUGCUACAUUAUCAUCAGUAAAGACACCACAGCUAAAGAAGUAGUUUUUCAUGCUGUUCAUGAAUUUGGUUUGACCGGUGCAUCCGACACAUAUUCUCUCUGUGAAGUUUCUGUUACUCCUGAGGGUGUCAUAAAACAGAGAAGACUUCCAGAUCAGUUCUCCAAAUUAGCUGAUAGAAUUCAACUCAAUGGAAGGUAUUACUUAAAAAAUAACAUGGAAACAGAAACCUUAUGUUCAGAUGAAGAUGCUCAAGAACUAGUUAAGGAAAGCCAGCUAUCCAUGCUGCAGCUCAGUACCAUUGAGGUGGCCACCCAGCUGUCAAUGAGGGACUUUGAUUUGUUUCGUAAUAUUGAACCGACUGAGUACAUCGAUGACCUUUUUAAGUUAAAUUCCAAAACAGGAAAUACUCAUUUGAAGAGGUUUGAGGACAUUGUAAACCAAGAGACAUUCUGGGUUGCCUCAGAAAUUUUAACUGAAGCAAAUCAGCUCAAACGAAUGAAGAUUAUUAAGCAUUUUAUUAAAAUUGCACUUCAUUGUCGAGAAUGUAAGAACUUCAAUUCCAUGUUUGCAAUAAUAAGUGGCUUGAACCUGGCAUCUGUAGCAAGACUCAGAGGAACUUGGGAAAAGUUACCAAGCAAAUACGAGAAACAUCUUCAAGAUCUACAAGACAUUUUUGAUCCAUCUAGAAACAUGGCAAAGUAUAGAAAUAUUCUUAGUAGUCAAAGUAUGCAGCCUCCAAUUAUUCCACUCUUCCCUGUUGUCAAGAAAGAUAUGACAUUUCUACAUGAAGGAAAUGACUCCAAAGUAGAUGGUUUAGUAAACUUUGAGAAGUUAAGAAUGAUUUCCAAGGAAAUCCGCCAAGUUGUUCGAAUGACUUCUGCUAACAUGGACCCAGCUAUGAUGUUUCGACAGAGGAAGAAGAGGUGGCGGAGUCUGGGGUCACUGAGUCAAGGAAGCACAAAUUCAAACAUGCUGGAUGUUCAGGGAGGUGCUCACAAAAAAAGGGCACGCCGCAGCUCUCUGCUUAAUGCCAAGAAGCUAUAUGAGGAUGCCCAAAUGGCAAGGAAGGUGAAGCAGUAUCUUUCCAGUCUCGAUGUAGAGACAGAUGAGGAGAAGUUCCAGAUGAUGUCAUUACAGUGGGAGCCUGCAUAUGGUACCUUGACCAAGAAUUUAAGUGAGAAAAGAUCAGCCAAAUCAUCUGAAAUGUCUCCAGUGCCUAUGAGGUCAGCUGGCCAAACAACUAAAGCCCACUUGCAUCAACCCCACAGAGUAAGCCAGGUGCUUCAGGUGCCAGCUGUUAAUUUGCACCCCAUCAGGAAGAAGGGACAAACAAAAGACCCUGCACUGAAUACAAGUUUACCUCAGAAAGUUUUAGGAACAACUGAAGAAAUAAGUGGUAAGAAGCAUACAGAAGACACUAUUUCUGUGGCGUCAUCUUUACAUUCUAGUCCUCCUGCAUCUCCUCAAGGCUCCCCUCACAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-372.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -402.73
Frequency: 0.0000
Diversity: 394.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((.((.............((((...)))).(((((..(((..(((..........)))..)))...(((((....((((.....))))..)))))...((((((((((((((((((((.((((........(((.(((((...(((((.((((((......((((((((.......(((..((.(((...(((((((.........))))))).))).))..)))...((.((((..((((((......(((((((((...(((..(((((((((.(((((((.(.((((...((.((((..((...((((.((.....(((((.....)))))......)).))))...))))))))...)))).).))))(((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))))..........(((((((........(((.(((....))).))).))))))))))..)))))))))...)))..)))))))))........))))))))))...)))))))))))))))))))))))))))))(((((.........))))).......((((....))))...((.((((((((.(((((((((((((........))))....)).)))))))..)))).))))))........(((.((((.......((((((((((((.(((((..((((.((....(((((((.......)))))))....((((((..((......))..))))))((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......))))))).))))))))))))..))))).)))).)))).)))))))))))).)))))....)).))))))))....)))))..)).))))))).((((((.........))))))(((..((((((..((.....))..)).))))...((((((((((.....)))).((((((...........)))))).(((((......))))).(((((((((((.....((((((((((......(((((.((((.((((.((((((((((........))))).((((.....((((.........))))....))))..)))))))))))))((((((((...((..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).))))))))))))...........)))))(((.....((((.(........).))))...)))........((((((........((((((......))))))........))))))......((((((........)))))))))))))))).....)))......)))).)))))))))).))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((.({........,.....,|...{{{|,.{((({..,,|}}|,{.,......,,||,..},,...{{(((,...{{{,,,,}}}}||..)))}|,..((((((((((((((((((((.((((........{{{{(((((.((((((((((((((,{....|}}|||,....,))))}|..|}))))}}}|{{((((,,,,,....||}|||,.,...||,.|||,,||||{({{..{{{{{{......{((((((({...{{,..(((((((((.{{((({{.,.{|||.,,,|.{{{{..{{...(((({({.....,||||,..,,||}},,}}}}})).)))}..,}})))))},..})}},},},{((((((((((((,...,{{,,..,,,.{{.,..},)))..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{{.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,.,.})))))))))))}.||.....{{{{{,{........(((.{{{....})}.))).))))))}}}},.)))))))))...}}}..})))))))).,......}}}))}||||,,,||||||,|{{|,||,,,}}})))))||,.(((((......,,.))))).......||||..,,||||...((.((((((((.{((((({{{(({(.,......))))....}}.))))))}..)))).)))))).,}},}}}(((.((((.......(({((((((((({((({{..,,,{.{{..,.(((((((.......)))))))....((((((..((......))..))))))((((((((.(((((((((....((....))...)))))))))...)))))))).....(((((......)))))}}.}}})))))),))}})),},})))).)))).)))))))))))).))))}...,)).)))))))).,,,,)))))})).))))))).((((((.........)))))){{,..((((((..((.....))..))}})))...(((((,((((.....)))).(((((({{......}}})))))).(((((......))))),((((((((({(,,...((((((((((......{((((.((((.((((.((((({{{((,..,,..,||}}},(({{.....||{{.....,..,)))}...,))}}..)))))))))))))((((((((...,,..((.((((((.(((((.((.........)))))))...)).)))).}))}))))))))...........)))}|(((.....((((.{........).))))...))),.......{(((((.,......((((((......))))))......,.))))),......((((((,......}))))))))))))))))..,,.}}}...,.))))).)))))))))).)))...,,}......,
Back