Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0010500
Sequence Length
1039 nt
GC Content
0.3840
UGUUCAAAGAGUUACUUUUUAGGACUGAACAAGAGAAAUCUGGUGUUCCUCAUAUUCCCAAAAUUGCUGAAAAAAAAAGUAAUCGCCAUUCUAUCCAGCAUGUGCCAGGAGAUAUUGAACAGACAUCACAGGAGAAAGGAAGUAAGAAAGUUAAAGCAAAUACUGUUUCAGGUGGAAGAAACAAAAUCAGGAAGAUUUUGGAUAAAACACGAUUUAGUAUCUUGCCUCCAAAGCUAUUUAGUGAUGGAGGCCUAAGCCAAUCACAAGAUGACAGCAUUGUGGGAACAAGGCACUGUAGGCAUAGUCUGGCUAUAAUGCCCAUCCCUGGAACACUCUCAUCCAGCAGCCCUGAUCUCCUGCAGCCUACCACCAGUAUGUUGGAUUUUUCCAAUCCUUCAGCUGUUGGUUUUUAUUAUAUCCCUGAUCAAGUUAUAAGAGUUUUCAAAGUGGAUCAGCAAAGUUGCUACAUUAUCAUCAGUAAAGACACCACAGCUAAAGAAGUAGUUUUUCAUGCUGUUCAUGAAUUUGGUUUGACCGGUGCAUCCGACACAUAUUCUCUCUGUGAAGUUUCUGUUACUCCUGAGGGUGUCAUAAAACAGAGAAGACUUCCAGAUCAGUUCUCCAAAUUAGCUGAUAGAAUUCAACUCAAUGGAAGGUAUUACUUAAAAAAUAACAUGGAAACAGAAACCUUAUGUUCAGAUGAAGAUGCUCAAGAACUAGUUAAGGAAAGCCAGCUAUCCAUGCUGCAGCUCAGUACCAUUGAGGUGGCCACCCAGCUGUCAAUGAGGGACUUUGAUUUGUUUCGUAAUAUUGAACCGACUGAGUACAUCGAUGACCUUUUUAAGUUAAAUUCCAAAACAGGAAAUACUCAUUUGAAGAGGUUUGAGGACAUUGUAAACCAAGAGACAUUCUGGGUUGCCUCAGAAAUUUUAACUGAAGCAAAUCAGCUCAAACGAAUGAAGAUUAUUAAGCAUUUUAUUAAAAUUGCACUUCAUUGUCGAGAAUGUAAGAACUUCAAUUCCAUGUUUGCAAUAAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-242.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -263.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 286.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(((((...(((((((.((((....(((((((((((.(((.(((.....(((...((((((.........)))))).(((((.((....)).))).))((((((.((....((((((.(((((((((((.(((.(((.....((((((.(((((..(((((((((((.......(((((((.....))))))).......)))(((.....)))..(((((((..(((....)))..)))))))..........(((((..........)))))(((....((((.(((((.((.....)).))))).))))..)))))))))))...((((..((((((..(((....((((....(((.....))).((((((....)))))).(((.((((((.((((((((((..((((((....((.((....)).)).....)).)))).((((....))))...........))))))))).).)))))).)))..))))....))).)))))).))))))))).))))))...))).)))........))))).)))))).)..))))))))))))).)))(((......))))))..)))..))))))...)))))....))))))..)))))...)))))..))))......))((((......(((((((((...(((..(((((((((.(((((((.(.((((...((.((((..((...((((.((.....(((((.....)))))......)).))))...))))))))...)))).).))))(((((((((((...........(((.((....)))))..(((((((((((((....((((......))))......)))))))))))))(((((.((......(((.(((.....))).))))))))))...........)))))))))))..........(((((((........(((.(((....))).))).))))))))))..)))))))))...)))..)))))))))........))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({..((({{..,{{{{{||,{{((,,,.((({{{{||{{,|||}{{{.....{{,...((((({.........||||||.((({(,((,,..}|,||}.}}((((((.,,..,{((((((.(((((((((({.{{,.{{,.....(({{((.{{{(({{((..{{.{(((,......(((((((.....)))))))..,....}}}|||.}}}}))}},(((((((..(((....)))..))))))).,,,{{,,,.,.,,.,{{{{{{{{||||||(((....((((.(((((.((.....)).))))).))))..}))|{(({.........})}}|{{{,,,|||,...}}}}.,.,|,|,..,,},,.((((((....)))))).(((,((((((.((((((((((..{{{{(({{..,{.{{....}}.,,.,,..}}.)))),((({....))))...........))))))))).).)))))).}}),,}..,...,||||)))),,))))},,))),))))}}{{{,,,.,))}.......})))).)))))).),.))))))})))))).)})|||.........|||..|}},,})}}||,,,})))}....}})))),,)}))).,,}})))..)))),,,,,,))|||,......(((((((((...(({..(((((((((.(((((((.{,({{{....,,((({..((...((((,({.....{{|{(,..,,||||}.,||,,)).)))}...)}))))}}}..))}}.|.,,{((((((((((((,...,{{,,..,,{.{{.,..,,))}..{((((((((((((....((((......))))......))))))))))))|(((((.{{.....,(((.(((,...,))).))))))))))}.....,,.,.})))))))))))},||.....{{{{{,{........{{{.{{{....}}}.})),))))))}}}}..)))))))))...})}..))))))))).,...,..}}}}
Back