Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0011900
Sequence Length
399 nt
GC Content
0.4135
UGUUCAAAGAGUUACUUUUUAGGACUGAACAAGAGAAAUCUGGUGUUCCUCAUAUUCCCAAAAUUGCUGAAAAAAAAAGUAAUCGCCAUUCUAUCCAGCAUGUGCCAGGAGAUAUUGAACAGACAUCACAGGAGAAAGGAAGUAAGAAAGUUAAAGCAAAUACUGUUUCAGGUGGAAGAAACAAAAUCAGGAAGAUUUUGGAUAAAACACGAUUUAGUAUCUUGCCUCCAAAGCUAUUUAGUGAUGGAGGCCUAAGCCAAUCACAAGAUGACAGCAUUGUGGGAACAAGGCACUGUAGGCAUAGUCUGGCUAUAAUGCCCAUCCCUGGAACACUCUCAUCCAGCAGCCCUGAUCUCCUGCAGCCUACCACCAGUAUGUUGGAUUUUUCCAAUCCUUCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-93.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -100.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 64.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.((((((...)))))))).)(((((...(((((((((((((((..(((((((.((...((((((.........)))))).(((((.((....)).))).))..)).)))).)))...)))))))(((((((.(((....................((((((..((..(((.......(((((((.....))))))).......)))))..))))))...(((((((..(((....)))..)))))))..........(((((..........)))))(((....((((.(((((.((.....)).))))).))))..)))(((((.........)))))....)))..)))))))((((.(((.....))).))))))))))))......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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