Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RAPGEF6_0013000

Sequence Length

1059 nt

GC Content

0.3371

CACCAUUUAUUCCUUCUUGAAUUCUAAAGUUGAACUUUUUAAUCAGACCUAUUUCUAUUUCCAAAAUGGGAUAUCACCAAAACUUAGUAAUACUUGAAGAUUUUAAAUGUAAAUUAAGGUCUGUAAAAUACUGAUGGAAUUAGUCCACUAAAGUGUCAUGAUUGGCGAUGACUCUAGUAUAUAUUACAUUAGCAGCUUCCUGAAGCAAUUACAAAAGUUCUAAUCAAGAGCAGUACAAUACUUAGCACAUAGUAGGCACUCAGUUUAUAUUUAUUGAAUAAGUUAAGACAGUGAAUAAUCAGUGAAUGAAAUAAAGCAAGUUCAAAAAAUACAUUAAAAGAAAAUACUUACUUGCCUCCUGAAAGUUCCUGGUAAUUGUGCCAGAUUAUAGUUAUAGGAACAAAAAGGGAUGGUCCUUACCUCUGAGAAAUUCACAUCAGGAACCCUUACUCUGUACACAUUUAUUAUAUACUAAGCCAGAGACAGGAAGAUAAAUAGAUCAAGGUUCUUAUCCUCCAAGAGUUGAUAAUCUAAGCAAAUUGCAAAGUUCUCAUGUUACAGGUUGAUAAGUGGAGGCAGGAACAAACUUGUUAGGUUUGAAUAGAUUGUGUUUCUGUAUAUGUAACUAGAGCCAGAGCAAGAGAAGUAGGUUAUGAGGGACCUUGAAUAUUAUGCUAAAGAUAAUAGACUUCAUCAUGUCAUGACAGGGAGCCAUAAGAAGACAUGGGAUUUGAUAAGAUCUGUUCUUUUAGGAAGACCUCUCUGAUGGCUGUGUUAGUGAUUUGGGGUUGUGGAUACAGCAUAAUAUAGCAGUGAUAGCAGAGAGAACAAUUGGGAGGCAACUUGGAAUUGUGUCAACUCUCAUCUUUAAUGAUAGCUAUUUUUAAAUAUUUUUUCAAUAAUUAAAAAUCUCGAAGUUUUUCCAAUCAGAUAUCCUCAUCUUCCUGAGUUCUUAUUUCCAGUCAGGGAAACACAUUUUCUCCUCAUUUAAUUUGGAACUCAGAGGAUUAAAAUACCCUGAGUUUUUUCUAAAAGUUCAUUACUCAUUCUAUCCUUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-220.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -244.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 293.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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