Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0015300
Sequence Length
586 nt
GC Content
0.3805
GCAACACCUGAGCGUCUCAUAAUGCAUUUAAUAGAAGAACAUUCCAUCGUGGAUCCAACUUAUAUAGAAGAUUUUCUAUUAACUUACAGGACAUUUCUUGAAAGUCCUUUGGAUGUUGGGAUCAAACUAUUGGAAUGGUUUAAGAUCGACAGCUUAAGAGAUAAGGUGACACGGAUUGUAUUAUUAUGGGUAAAUAAUCAUUUUAAUGAUUUUGAAGGUGACCCUGCUAUGACUCGAUUUCUAGAGGAAUUUGAAAAAAAUCUGGAAGAUACAAAGAUGAAUGGUCAUCUCCGGUUAUUGAAUAUUGCCUGUGCUGCAAAGGCUAAGUGGAGACAGGUUGUGCUGCAAAAGGCUUCCCGCGAGUCCCCUCUACAAUUCAGCCUUAAUGGAGGGAGUGAGAAGGGAUUUGGUAUUUUUGUUGAAGGAGUAGAACCUGGUAGCAAAGCUGCUGAUUCAGGACUGAAACGUGGUGAUCAGAUUAUGGAAGUAAAUGGACAAAACUUUGAGAAUAUUACAUUUAUGAAAGCCGUUGAAAUUUUGAGGAAUAAUACUCAUCUUGCACUUACUGUGAAGACCAACAUUUUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-134.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 152.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((....(((((.(((.((..............(((((((..((.((((((((....((((((....))))))..((((.(((((....))))).))))((...))..))).)))))..))...)))))))..............))))).))))).))))).....(((((..((((...((((....((((((....)))))).........))))....))))..)))))((((((...............)))))).....((((((((..(((((.((((((.(((.........((((.........))))))).))))))((((((.((((.(....(((......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).))))))))........)))...).)))).))))))(((((...)))))((((.((..((......))..))))))....((((..(((((((.....................))))))).....))))........((((........)))).....(((.....)))..))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((((....{((((.(({.((..,{.{{...,{{.(((((((..{{.((((({((....{(((({....)))))),,|{({.(((((....}}}}).)})}||,.,}},.)))}}}}))..}}.,.})))))).}}}...,}.,,..))))).))))).))))).....{((((,.((({...((({....{{{(({..,,}}}}}}.,,.,,,,.))))....})))..)))}|((((((.....,,........)))))),....((((((((..(((((.((((((.(((.........((((.,,...,,.))))))).))))))((((((.((((.(..,,({{......((((((((.(((.((.(((..((.....))..))).))))).)))))))).......,))}...).)))).))))))(((((...))))){{,{{((..,{,,,..||||||,,}}},,,,{(((..(((((((..........,..........))))))).....)))}........((((........))))..,,.(((.....)))..))))).))))))))
Back