Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0018000
Sequence Length
441 nt
GC Content
0.3923
GUAGAGAAUGCCAAAGAUAAUGAAGAUAGUAUUCUACAAAGAGAAAUUCCUGCCAGACAAUCCCGAAGAAGAUUUCGGAAAAUUAACUAUAAAGGAGAGCGCCAAACCAUUACUGAUGAUGUGGAGGUUAACAGCUAUCUUUCUCUUCCAGCUGAUCUUACCAAGAUGCAUCUCACAGAAAACCCUCAUCCACAGGUGACUCAUGUGUCUUCUAGUCAGUCUGGUUGUAGCAUUGCCAGUGACUCUGGAAGCAGCAGUUUAUCUGAUAUCUAUCAGGCAACACCUGAGCGUCUCAUAAUGCAUUUAAUAGAAGAACAUUCCAUCGUGGAUCCAACUUAUAUAGAAGAUUUUCUAUUAACUUACAGGACAUUUCUUGAAAGUCCUUUGGAUGUUGGGAUCAAACUAUUGGAAUGGUUUAAGAUCGACAGCUUAAGAGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-100.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -109.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 88.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((............(((.......)))...........))))))))(........(((((......)))))..............((((.(((....((((.((((.......)))).))))....))).))))((((((..((((((((((...)))))...............((..(((((((((((((....(((..(((((((.....(((((.........))))).....)))))))..)))..))))))).......(((((.....)))))((((......))))...((((((((((.(.(((......((......))......)))).))))))))))((((.(((((....))))).))))....))))))..))(((((((((((....)))))))..))))..))))).))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.((((...........,{,(,,.....}))}.,........))))))))(........(((((,....,)))))..............{(((.(((....((((.((((.......)))).))))....))).))))((((((..((((((((((,,,|,|||.,..,,....||...(({.(((((((((((((,...(((,.((((((({{{..(((((.........))))),})},}}))))),,)))}.))))))).......(((((.....)))))((((......))))..{((((((((((.,.(((,{,..,||......}}...,,.))),.))))))))))|,,,.,(((({.,,|,,,},)}))}}}.))))))..))|,||,{{{{{,,,..,))))}},}))))..})))).))))))...)
Back