Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RAPGEF6_0018800
Sequence Length
1384 nt
GC Content
0.4451
AGUUCGGACCUUGUUACGGCGCGAAGUUCCCUCCUUGGGGCGGGGGAAAGGUACCGCACCCGCUACCUAGUGUGAAUGAACUGUGGCGUGGGCUGCUAAGGGCAGGCUGCGGAGUACCCGGGCCGUGGCCAUGAACUCACCCGUGGACCCUGGCGCUAGGCAGGCGUUGAGGAAGAAGCCACCCGAGCGGACUCCCGAGGACUUAAAUACUAUUUAUUCUUAUCUUCAUGGAAUGGAAAUAUUAUCAAAUCUCAGGGAACAUCAGCUUAGAUUAAUGUCUGCAAGAGCACGCUAUGAGAGAUACAGUGGCAAUCAGGUUCUCUUUUGUUCAGAAACGAUUGCCAGAUGUUGGUAUAUCCUACUUUCUGGAUCUGUGCUUGUGAAAGGCUCCAUGGUCUUGCCUCCUUGCAGUUUUGGUAAGCAGUUUGGAGGAAAAAGAGGAUGUGAUUGUCUUGUAUUAGAGCCUUCAGAAAUGAUUGUGGUAGAGAAUGCCAAAGAUAAUGAAGAUAGUAUUCUACAAAGAGAAAUUCCUGCCAGACAAUCCCGAAGAAGAUUUCGGAAAAUUAACUAUAAAGGAGAGCGCCAAACCAUUACUGAUGAUGUGGAGGUUAACAGCUAUCUUUCUCUUCCAGCUGAUCUUACCAAGAUGCAUCUCACAGAAAACCCUCAUCCACAGGUGACUCAUGUGUCUUCUAGUCAGUCUGGUUGUAGCAUUGCCAGUGACUCUGGAAGCAGCAGUUUAUCUGAUAUCUAUCAGGCUACGGAGAGUGAGGUAGGAGAUGUAGAUUUGACACGUCUUCCAGAAGGACCUGUUGAUUCUGAGGAUGACGAAGAGGAAGAUGAAGAGAUUGAUCGAACAGAUCCAUUGCAGGGGCGAGAUCUUGUUCGAGAAUGUCUUGAAAAAGAACCUGCAGACAAAACUGAUGAUGACAUUGAACAAUUGCUGGAGUUUAUGCACCAGCUCCCUGCAUUUGCAAACAUGACCAUGUCUGUAAGGAGAGAACUCUGCUCAGUGAUGAUUUUUGAAGUGGUAGAGCAGGCUGGAGCUAUUAUUCUUGAAGAUGGGCAAGAGCUUGACUCAUGGUAUGUUAUUUUAAACGGCACUGUGGAAAUCAGUCAUCCAGAUGGAAAAGUUGAAAAUUUGUUUAUGGGAAAUAGUUUUGGAAUUACUCCCACUCUGGAUAAGCAGUACAUGCAUGGAAUUGUCAGGACUAAAGUAGAUGAUUGUCAGUUUGUCUGCAUAGCCCAGCAAGAUUAUUGGAGAAUUUUAAACCAUGUGGAAAAAAAUACCCAUAAAGUUGAGGAAGAGGGAGAAAUUGUUAUGGUACAUGAGCAUCGGGAACUAGACCGGAGUGGAACCAGGAAAGGACACAUUGUGAUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-400.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -429.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 431.51
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......((((((((.((..((...((((..(((((((..........)))).)))(((((..(((........))))))))((((.(((((...))))).)))))))).)).)).))))))))..))))))(..((.(.(((((((.(....).)))).))).)))......(((((((..(....((((((.(.((((..((((((...(((((.(((((.(((((((....)))).))).((((((((((..((.(((((........((((((...(.((((((......(((((((.((((((((.((((((((((...((((((.((((((((.....))))).)))....))))))((((((.((((.....))))..)).))))...(((((..((.((((....)))).))..))))).)))))))))).)))))))))))))))..))).((((((((((((((((((((.((((............(((.......)))...........)))))))))..))))))(((((......)))))...............((......))....(((((((((....((((((.........(((((((((((((.((.(((((((...))))).)).))............(((((((((.(((...))).)))((((((.(((.(((..(((((((....((((.....))))((((....))))..(((((....))))))))))))))).)))..))))))...((((.((((((.(((((.....))))).)))))).)))).)))))).)))))))))))))((((.(((..(((((((((((..((((....)))))))).))))))).))).)))).........((((((((((....((.(.(((...(((..(((.(((.((((((........))))))..))).)))))).))).).))))))))).)))......))))))))))))))))))))))))))).)...))))))..)))))))..)))))).))))((((...(((((((((((((((.((((......))))..))))))).........(((((((.(((..((((..(((.((((((.....)))))).)))..))))..)))...)))))))..(((.....)))........)))))).))...((((((((........))))))))...))))..(((..((((.((.(.(((((...((....))...))))).)))))))..)))..)))))..)))))......))))))..))))).))))))....)..))).))))..((......)).(((...))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((......((((((((.((...((((((((....|}.))))))}.(((((((({((((((((..(((........))))))))),)|,(((((...))))).}))))).,)))))).))))))))..))))))(..{(.(.(((((((.(....).)))).))).)))......(((((((..(....((((((.(.((((..((((((.,,(((((.(((((.,|||{{{,...,,,|.,|...((({{,{{....{{.{{{{((((....))))},..||||,,,}|.}||||{{{{({,{(((((((,,,{((({{,,,..,,||||,}||||||||,.,||,||||,||}|...,})))))}}.,))}}}}.{{{((,.((((({{((((((({(((,{((,{(((((((({|{{(|,,((((({.|||||||,|,|||||||||,|||,,..,,,(((((.....,{{{,(((((,.,,,|}}}}...,,..}}}}}......||||......}},.,}}},))),)}))))))(((((,....,)))))...............|{..,{{.,,.((((.((((.......)))).)))).,,,}}}.}))}|,|)))))}}))}..}})))))))))))|{{{...,,,....,,((((((,(({((({,.,.|,|||(((((({(((.{(({{(,{{,,{...}||||.,},,}}))||||.,,,}}}},||||{{..,,|||}}|||}},.,}),)},},))))}}}}.{{({.((((((.(((({.....})))).)))))).)))).)))))).}..,}))},,.|.((((.(({..(((((((((((..((((....))))))))}})))))).})).)))).}.........(((((((((((((((((((..{{((,.,(,,,.(((((.((....)).))))).,({((((,,{{(,,,((({.{(((({(({{.,{,{({...||||,|||,,,{{{{((((((,.((((,{,({{((((((...(((,|{,|{,,...,))}})))...)))))).))),,,,|,||||......,}},.}})),.}}}}}}))})){((((((,(({..{{((.(((({(,{(((....,))}})))))).}),}}..)}),,.))))))}..)))).}})))))})}}}}))})))}......,}.},)})))))))))))))))))).....,.))))))))},}))))..)))),,,{..(((((..........)))))..)))},,))))),,))))}.,,,..))))))..))))).))))))....)..))).))))..{{......}},{{{...})}..}..)
Back