Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RIMS2_0003200

Sequence Length

323 nt

GC Content

0.4427

GAGGACAAAGUGGUUAUGUGGGUAUGUAAUUUGUGCCGAAAACAACAAGAAAUCCUCACUAAAUCAGGAGCAUGGUUUUAUAAUAGUGGAUCUAAUACACCACAGCAACCUGAUCAAAAGGUUCUUCGAGGGCUAAGAAAUGAGGAGGCACCUCAGGAGAAGAAACCAAAACUACAUGAGCAGACCCAGUUCCAAGGACCCUCAGGUGACUUAUCUGUACCUGCAGUGGAGAAAAGUCGAUCUCAUGGGCUCACAAGACAGCAUUCUAUUAAAAAUGGGUCAGGCGUGAAGCAUCACAUUGCCAGUGACAUAGCUUCAGACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-77.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -81.47

Frequency: 0.0026

Diversity: 37.14

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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