Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RIMS2_0008700
Sequence Length
288 nt
GC Content
0.4167
GAGACAUGGAUUACAACUGGUUGGAUCAUACGUCUUGGCAUAGCAGUGAGGCAUCCCCAAUGUCUUUGCACCCUGUAACCUGGCAACCAUCUAAAGAUGGAGAUCGUUUAAUUGGUCGCAUUUUAUUAAAUAAGCGUCUAAAAGAUGGAAGUGUACCUCGAGAUUCAGGAGCAAUGCUUGGCUUGAAGGUUGUAGGAGGAAAGAUGACUGAAUCAGGUCGGCUUUGUGCAUUUAUUACUAAAGUAAAAAAAGGAAGUUUAGCUGAUACUGUAGGACAUCUUAGACCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-63.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -70.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 107.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((..(.((((.(..(.(((.......))))..).))))..)..))))...))))))(((((...))))))(((((..(((((....))))).(((((......)))))(((((((..........(((((...)))))))))))).((((((..(((((((((...)))...))))))..))).)))....((((((.((....((((((((((...(.(.(((.((((....)))).))).).).....))))))).)))..)).)))))).).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{...,,,{{{,.{,,,,,,||||||},...,||((({{...{(({,,(((({(,,...})))))}|}|..(((((((((({((..(((((....))))).,{{(({{,..,|||}|{{,{{{,...,,,,..}||||},,.)))))}{{{|{{..(((,,,...,,,|}}..,}}))).))),,.)))))))))).,..{(((((,((....(((|(|((((,,.{.{.(((,(({{...,)))).,,,.}}),}},.))))))).}})}})}.)))))}.}.))))
Back