Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RIMS2_0015300
Sequence Length
511 nt
GC Content
0.4110
AGAUAUACCGCGAAUACCUGAUAGCACACAUGCACAACUGGAGUCCAGUUCUAGCUCCUUUGAAUCUCAAAAAAUGGAUCGUCCUUCUAUUUCUGUUACCUCUCCCAUGAGUCCUGGAAUGUUGAGGGAUGUCCCACAGUUCUUAUCAGGACAACUUUCAAGCCAAAGCCUUAGUAGAAGAACAACGCCUUUUGUUCCUAGGGUUCAGAUAAAACUAUGGUUUGACAAGGUUGGUCACCAAUUAAUAGUUACAAUUUUGGGAGCAAAAGAUCUCCCUUCCAGGGAAGAUGGGAGGCCAAGGAAUCCUUAUGUUAAAAUUUACUUUCUUCCAGACAGAAGUGAUAAAAACAAGAGAAGAACUAAAACAGUAAAGAAAACAUUGGAACCCAAAUGGAACCAAACAUUCAUUUAUUCUCCAGUCCACCGAAGAGAAUUUCGGGAACGAAUGCUAGAGAUUACCCUUUGGGAUCAAGCUCGUGUUCGAGAGGAAGAAAGUGAAUUCUUAGGCGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -133.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((....((((..........(((....)))..((((((...)))))).....((((((((...)))))....))))))).....)))))((.......(((((((...((((((((...((.(((....))).))(((((....)))))..(((((((((((.((((((((.....((((((......))))))))))))))............)))))))).)))(((((...)))))................(((((........)))))))))))))...)))))))(((.((((((..............((((((((((((........((.......)).........(((.....))).........((((((....(((((((........)))))))....))))))...(((((......)))))(((((...(((...(((..(((...)))))).)))...)))))....)))))))))))))))))).))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{,,....,((,....{{,,,..(({....}))..{(((((...)))))}...}}||,(((({...})))}.,,{(({.|||,,,||}}}}|{{.....,{(((((((...{((((({|..,,||(({,||,||}...{{,,,....}))))|.|||{(((((({.((((((((.....((((({......)))))))))))))}.........,|.}))))))},,}}||||||,.||||,.....,,.......,,||{{{,......,})))}}}))))))...)))))))|{,,{{|..,}}},.......{((((((((((((((...,....{|........,.........,{{.....,||.........{(((((....{((((((........)))))))....))))))...(((((,....,)))))|.,{(,{{{(({({(,,..{{|,,,)),})}...||{|}}}})),,.))))))))))))))).}},)))},}
Back