Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RIMS2_0016700
Sequence Length
1415 nt
GC Content
0.4438
GUUCUAGCUCCUUUGAAUCUCAAAAAAUGGAUCGUCCUUCUAUUUCUGUUACCUCUCCCAUGAGUCCUGGAAUGUUGAGGGAUGUCCCACAGUUCUUAUCAGGACAACUUUCAAGCCAAAGCCUUAGUAGAAGAACAACGCCUUUUGUUCCUAGGGUUCAGAUAAAACUAUGGUUUGACAAGGUUGGUCACCAAUUAAUAGUUACAAUUUUGGGAGCAAAAGAUCUCCCUUCCAGGGAAGAUGGGAGGCCAAGGAAUCCUUAUGUUAAAAUUUACUUUCUUCCAGACAGAAGUGAUAAAAACAAGAGAAGAACUAAAACAGUAAAGAAAACAUUGGAACCCAAAUGGAACCAAACAUUCAUUUAUUCUCCAGUCCACCGAAGAGAAUUUCGGGAACGAAUGCUAGAGAUUACCCUUUGGGAUCAAGCUCGUGUUCGAGAGGAAGAAAGUGAAUUCUUAGGCGAGAUUUUAAUUGAAUUAGAAACAGCAUUAUUAGAUGAUGAGCCACAUUGGUACAAACUUCAGACGCAUGAUGUCUCUUCAUUGCCACUUCCCCACCCUUCUCCAUAUAUGCCACGAAGACAGCUCCAUGGAGAGAGCCCAACACGGAGGUUGCAAAGGUCAAAGAGAAUAAGUGAUAGUGAAGUCUCUGACUAUGACUGUGAUGAUGGAAUUGGUGUAGUAUCAGAUUAUCGACAUGAUGGUCGAGAUCUUCAAAGCUCAACAUUAUCAGUGCCAGAACAAGUAAUGUCAUCAAACCACUGUUCACCAUCAGGGUCUCCUCAUCGAGUAGAUGUUAUAGGAAGGACUAGAUCAUGGUCACCCAGUGUCCCUCCUCCACAAAGUCGGAAUGUGGAACAGGGGCUUCGAGGGACCCGCACUAUGACCGGACAUUAUAAUACAAUUAGCCGAAUGGACAGACAUCGUGUCAUGGAUGACCAUUAUUCUCCAGAUAGAGACAGGGAUUGUGAAGCAGCAGAUAGACAGCCAUAUCACAGAUCCAGAUCAACAGAACAACGGCCUCUCCUUGAGCGGACCACCACCCGCUCCAGAUCCACUGAACGUCCUGAUACAAACCUCAUGAGGUCGAUGCCUUCAUUAAUGACUGGAAGAUCUGCCCCUCCUUCACCUGCCUUAUCGAGGUCUCAUCCUCGUACUGGGUCUGUCCAGACAAGCCCAUCAAGUACUCCAGUCGCAGGACGAAGGGGCCGACAGCUUCCACAGCUUCCACCAAAGGGAACGUUGGAUAGAAACAAUGGAGUCAAGGAGAUAGAACCUUAUGAAGAACUGGACUCUACAAGGAGAAGAUAUGCAGGUACUAUGGAUAUAGAGGAGAGAAAUCGCCAAAUGAAAAUUAACAAAUACAAACAGGUAGCCGGAUCAGAUCCCAGACUGGAACAAGAUUACCAUUCGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-381.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -409.79
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((..(((((...)))))....(((((((((..((((..(((((.(((((.((((.(((((((..(((((..(((....))).((((((((((((((((..(((((((((((.((((((((.....((((((......))))))))))))))............)))))))).))).(((.((.((((...............)))))).)))...((((((((...)))).))))((((((((((((...)))).......(((((((((((((((........((.......)).........(((.....))).........((((((....(((((((........)))))))....))))))...(((((......)))))(((((...(((...(((..(((...)))))).)))...)))))....)))))))))))))))....(((....(((((((...)))))))....((((((...)))))).)))....((((.((...((((...(((((((((((.((((((((.((((((.....(((((((((....((..........))...))))))).))........)))))).))...(((((.((.(((((.(((....(((((((((.((((((.(.(((((((((....((((((...)))))))))))).)))).)))))))))).))))).......(((((((..((......))..)))))))........)))))))).......(((((.(((((((.....)))......((...(((((.....)))))..))...((((((..((((((.........))))))..))))))...)))))))))...)).))))).......................)))))).)))))))))))..))))))))))....((((......))))...(((((((((....((.........))....))))).))))................))))))))...((((((........))))))(((.....)))...)))))))))......((((((((((....(((.......((((((((((.((.((((((...((.(((((......((((......))))(((((((((.(((....))).))))....))))).......)))))..)))))))).))...))))).....((((......)))).(((((........))))).)))))))).....).))))))))))))))))..((((....))))..))))).)))).)))))))....))))).((....))........................)))))))))..))))..))))).)).)))))))..((.......))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{{{,,.,|{(((((,,.||,......(((((((((,,((({.{(((({.{((((,({{{{{(((({(,|{{{{{..(((....))).{((((({(((((((((..(((((((((((.((((((((.....((((({......)))))))))))))}..........,.)))))))).})),|((.((.((((...............)))))).))}...((((((((...))))},)))((((((((((((...))))...,,,.(((((((((((((((...,....{|........,.........,{{.....,||.........{(((((....{((((((........)))))))....))))))...(((((,....,)))))|.,{(,{{{(({({(,,..{{|,,,)),})}...||{|}}}})),,.))))))))))))))).|,,|{{,.|.{(((({{...})))))}.,..(((({{...}))})).|||....||||.{{...{{{{,.,(((((((((((.((((((((.((((((.....{((((((((....((..........))...)))))))},)........)))))).))}..(((({..,.,....,((,({{{((({((({(,{{{{{{.(,{{((((((({,..{(((({..,}}}}|||||}|||||,,.}}}))))))),))}},..,,},.{|{||||,,((,,..,,||..||}}}|}......,,,)})))))...,,,,{((((,(((((((.....)))}....,||...(((((.....))))).|||...((((((..((((((.........))))))..))))))...}}))))))},}})).))))}((.,................)),,))))).))))))))))),.}}}}}}})))....((((......))))...(((((((((....((.........))....)))))},)))...,,....,,.....))))))))|..((((((........)))))){{{.....)))...)))))))))......((((((((((..,.{(({,.....{(((((((((.((.((((((.,,{,.(((((......((((......))))(((((((((.(((....))).))))}...,)))).......)))))..)})))))).))...))))),....((((......}))),(((((........))))).)))))))),,.,.),}))))))))}))))))..((((....))))..,}}|}.}})).}}}}))),.,,}}}}).{|....}}.,,...,,................,}}}|||||..||}|,.}}}}}..},)))),,,..|,,,.,,,}))}}}}
Back