Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RIMS2_0024700
Sequence Length
718 nt
GC Content
0.3705
GGAUUGUGAAGCAGCAGAUAGACAGCCAUAUCACAGAUCCAGAUCAACAGAACAACGGCCUCUCCUUGAGCGGACCACCACCCGCUCCAGAUCCACUGAACGUCCUGAUACAAACCUCAUGAGGUCGAUGCCUUCAUUAAUGACUGGAAGAUCUGCCCCUCCUUCACCUGCCUUAUCGAGGUCUCAUCCUCGUACUGGGUCUGUCCAGACAAGCCCAUCAAGUACUCCAGUCGCAGGACGAAGGGGCCGACAGCUUCCACAGCUUCCACCAAAGGGAACGUUGGAUAGAAGUAAGUUUUAUUUCUAAUUGUCUCGUUUAGGAAAUACACAUGGAAGCUAAGGUGAAUCAAGAUUUUCUUAUUACCUUUGUGUUAAUUUUCUUCUUUUGUUAAUUGUAUGCCUUGUCUGUAUUUGAUAAUAGUUAUAUUUAUAAAUAUUAUGUAUUUUUGAAUAAAAAUUUGUAAUAUUUCCAGGUAAAAUAAGGUAUCUUUAUUGCUCUUGCACAUUUUUAAAUUUGAAUAAAUGCAUCUUAAAAAGUAAACAAUACUCUUAAAUAAGUUGUUGGAUAAUAUUUCUUUGCUACAAAUAAGUUUAUGUAAUUGUUGAUAGUUAUAUAAAGUUUAUUAGUAACUAGCCAAAUCAAUUUUCACACACUGCAAAGGACUGGUUAGCUGAUGCACAAUGGUGAUCCUUCUCAAAACUGGAGAACAAGAAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-159.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -176.92
Frequency: 0.0000
Diversity: 206.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((....((.........))....))))).))))..(((((((((.(((((((((((....((((((........))))))(((.....)))..(((((((...........(((((((....))).))))....(((((((.............................((((......))))(((((((((.(((....))).))))....)))))))))))).))))))).))))))))..((((((((((((((((.......)))).))))..(((((((((...)))))))))..(((.((......))...)))..))))))))(((((((...((((...)))).))))))).(((((((((..(.......)..))))).)))).))))))))...))))........((((((.((((((...)))))).)))))).....((((....(((((((.......((((.(((.((((((....((((((...................(((..........((..(((((..(((....))).)))))..)).........)))(((.((((((((((((((((((....)))))))))))).)))))).))).(((((((..((..(((.((.....)).))).)).))))))).)).)))))))))).))))))).......))))))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((....((.......,.))....))))}}}))}.,{{{{{{{{{,{{.((((((((.,,.((((((........)))))){||.....}}}..(((((((...........{{(((({....)))}}))}...{(((((((.{,,..,,.............,,.....,((((......))))(((((((((.(((....))).))))}...,)))))))))))}))))))).))))))))..((((((((((((((((.,....,)))).))))..(((((((({...}))))))))..{{{.{{.....,))...,....)))))))){((((((...((((...)))).))))))),{|||{,{{{..{.....,,},.}}}}|.||||{||||}}}|,,,||}}{{,,,.,.||{|||.{((((((((|.(((({|....)))))).})))))))}|,|||},,..,}||||,|||.{{{{(({...,|||.,,,(,,,....,}},....||||,,......{{{{..(({{{||.,,....,}),))))|,,......,,,.,{{|({,.,{{((,((((((((((((....)))))))))))).))}}})|))}|(((((({..,{..,{,.{,.....}).}}}}),.))))))),,)})))}}}}}}},))))}||{,,....}}}))))},.,,.....,
Back