Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RMST_0000600
Sequence Length
1859 nt
GC Content
0.4309
AAAAUAAUGGAGCCUGACUGUGAGAACUGUCUGUAUUCAAACAUGUUAAGAGCUGAAUAUUUAAAAUUUGUUUGGCUCACCAAGCUUGGCUUUCUGAAGACAACAGAAGUGGGAUAGAGAGAUCAAAAAGAAAAAAAAAAUCAUAAAAGUAUUGCUAAACAAUCAAAUGCAAGGUAUUUUGUCUUCUUUCACUCCUUAAAAGAAAAUCAAUCAAUUAAUACACAAAGAUAAAAGUGAGAAACCUACUGUAAUCUACUAAGGUCCAGGAAUUUAAAGAAUCAAAUGUACCUUCUGGGUUUCGGAAUCCAUCGGGGAGAAUGUAGAGGGUGAUGAGAAGACUUUGCAUUUGACCAAAAAGCACUAGUAAAUAAGGAGUUAAAAUGAAGGCAGGCUCGCUGGUUUGCUGAGAUCUGUCAGAGUCUGACUGGCUGGCUACAUAUCUGUCUCUGGAACAAUAGGUACCUGUAUUCUGCACGGACUGCUGGGCAGCACUAGCACUCUGGAGAAGGUCUGCCGCUGUCUGCACUUUCCUGGUUCUAUGCAGGCAGAUGAGUGUCACAGCUGUAACUGAGGCACAGAGCAGUACACACAGUGGAGCCGAUUUCCGCGAUGGCGAGAGGGGGCACCGGAGGUGACAACAAUAACAAGACUGUCCUUCGGACAAGUUUUAGAUUCUCAGGAUGAUGGAGUGAGUGAUGGAAUAGGUUGCCAACUGUAGUUACUCCACUCAGCACAGAAUGGCUGCGGGGAAAUAUAAUCAGACAUGCCCAAAGAAGUCUGCUUAGGGUGAAACAAAUACCUUUGAGGUUUAAAUCAGAAAGGAAGGAGAGACUGUUUCUACAGGUGUCAUACAAAAAUCAAUACUGAGCCAAGGAUUAUUGGAUCCCAUAGAACCACGGAGACUUGGUAGUGAAAUUCUUCCAAAGCAUUCCAUCCGUGCAGGCAGAUGGUGUUCCUAGGUUUGGAAAUAUAAAUCCCAUGGGAAGUCAGCUGAAGACCAUUUUAUGCAUCACUCAUCCUGUUAGAGCCCUGUGCUGUUCUGUCUCUCUAUAAGACUGGCUGAAACCACCACGGUUGUUUACAAUUUAUGCUCUAACUUUGGAUCACCUAGUUAAUACUCUAACUCCGAUUAUUACCAAAGACAAUGUUCUAUAAAAGAUAUUGUCUAUUAGAAGGAUGCUUCUGCAUUAUUAAUAAAAUCACAGGGAAAAUGCAACAUUUUGGAUGUCACAUCUGAUAAGUGGGUGACUGAUCGUACCCGCCAGCUGGCUAAUGUCAUAAUUAACAAAGUUGCUACUACAUCUGCAAAGUUUAAUCGAAAAAUUUGCCAGUGAUAUGAUGGCCUUGUCACAGAGAUCACAAGGGACACGGAGUUGACUUUUGCUCAAGGUGGAACGACAGAGCUGUGUAGGCAAGAUGAGAAAUUGCGAACUUGUUCGGCCAAAGGAGGCUAAUAAUGAAGGGGCCGGGAAGGAGGCCAGUGCUACCAGGGUUAUCUCACAACCUCAGAUGCUGGAUAAGUCGACGGAGGCAGAAUCGCUUUGGGAUGACAUUCAGAAAGCCUGGAGUGAUUACUUGCAAGAGAAAAGCCUACCUAUUCUUUCCAAGGUGCAGGAAUAUUCCCCUGACCUGCUCAUCCAGUGGUCCAGUAAUGAAUUACUGGAGACCUGCCUUAGACAAAGAAUGCACUCGGAGCCCCAACACACCUAAAGCCAUGCUUUGAAGGAUCUGCCAAGCUCACUUUUAAUCAUGAGAAAGAAAUUACCCACACGGAGUCAGCAGAAAAUGAGAAAGUAGAGCUCGUGCUGUGAAUAAUUCCAGCAAGUGCCAAGGGGCUAGUUGAGGAAUGGCUUCAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-510.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -546.16
Frequency: 0.0000
Diversity: 365.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((((.(((.((....)).)))(((((((...........((((((((((.........)))))))))).(((....))).((((((.......)))))).......((.(((((............................((((......(((((((((((((.(((((((((((((((((((((............................((((...((((.......))))...))))...(((((.((...((((...))))....)).))))).((((((....))))))..))))))..)).)))))).)))))))..)))))))))))))......)))).((((((((.(((((((............))))).)).)))))))).))))).))...((((((..(((.((...............(((((.((((((((.((...(((((((((((.((((((......)))))).))))........(((((.(((((.((.(((((((((((((.....((((......)))).(((((((....((((.((((((((((((((((..(((.(((..(((((((....))).)))).))).)))...)))...........((((((((((...)))).))))))...(((((((((((((((((((((((((...((((........)))).)))))).))))).(((.((((((((((((.(((....(((.(((((............))))).))).((((.......))))(((((........)))))..(((((((((.(((((....))).)).)).............((((..((((((..((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))...)))))))...........))).))))).(((.(((..((((((((((((......))))))...)))))).))).)))....))))))).)))..)).))))))))..))))...))))))))))))).))))......)).))))).((((.....))))(((((((......(((((....(((..(((((((((......((.(((((((...........((((((((((........))))))))))...(((((....)))))(((((....................)))))......(((((((...)))))))...(((((((........)))))))..((((((.(((......(((((.....((((..........))))...)))))......))).))))))..........((((((..........))))))....))))))))).....)))..))))))..))).)))))..)))))))..((((((..........)))))).((((......)))).........)))))))))))))...((((((((....(((((.......))))).)).))))))....)).))))).)))))((((((((((((...............))))))))))))...))).))))...))..))))))))..)))))((((.((((........))))))))..((.(((((((((.((....)).))))))))))))).)))))))))...)))))))(((((((((((....(((.((((((...))))))..((.....)).(((((((((((..((((.........(((.((.....))))).........)))))))))).)))))..(((((.(((...)))))))).)))....))))))..)))))....))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
......((((((((.(((.((....)).)))(((((((.....,,,,..((((((((((.........)))))))))).{{,....|||(((((((....{..|,,,,)},,..}}}}}}}.||.........................,,.((((......(((((((((((({.{{{{(((((((((((((((((....,.......................{{{{...{{{|.{....|}}}}...}}}}...{((((.((.,,,{{{...}},,....)).))))).||||||,}.,,,|||,..,})))}..}}.}))))),))})))),,)))))))))))))......)))).||.|...,.,,,,,|,......{(((((((|{((((((,,.{(,{({{{,,{||{{,{{|,,}},}}}}|||.,,...,,,}}},,(((((.((((((((.((...(((((({((((.((((((......)))))).)))).......{(((((.(((((.((.(((((((((((((...,,((((......)))).(((((((....((((.((((((((((((((((..(((.(((..(((((((....))).)))).))).)))...)))...........((((((((((...)))),,))))).,.{((((((((((({((((((((((((...((((........)))).))))))}})))).(((.((((((((((((.(((....,,,.(((((.{........,.))))),|||(((((.......})))|{({{........))}},..(((((((((.(((((....)))),).)).........,,..,{{{,.((((((..((..(((.((.....)).)))..))..))))))}}},...)))))))...........))).))))).(((.{({..(((((((({(((......))))})}..)))))).))).)))....))))))).)))..}}.))))))))..)))}...))))))))))))).))))......)).))))).,(((.....)))|(((((((......(((((....(((..(((((((((.,{...((.(((((((...........((((((((((,,.....,))))))))))..,(((((....))))}|{{{{.{,.......,,.,....|.|||||,.,.,,||{{{((,..}})}))}...(((((((.,.....}))))))),.{(((((.,((.,....{{(({.....((((..........))))..,}}}}}......})).))))))}.,.,,.}|.((((((..........))))))....)))))))))...,,)))..))))))..))).)))))..)))))))},.........,}}},..,{{{{{.((((......)))),}}},....)))))))))))))...((((({{{....((({{.......}}))).,}.))))))....)).))))).)))))|(((((((((((.,..,.....,....)))))))))))}...))),,)))...))..))))))))..)))))((((.((((........))))))))}}....)}}))}|(((((((,....)))))))),.)))))))).,,,,..)))))))(((({((((((..,,(,(,((((((...)))))}..||.....}}.(((((((((((..((((.........,,,.((,....)),)).........)))))))))).)))))..(((((.(({...}))))))).)))....))))))..}))))....))))))))...
Back