Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RMST_0001300

Sequence Length

1122 nt

GC Content

0.4412

GGGUGAUGAGAAGACUUUGCAUUUGACCAAAAAGCACUAGUAAAUAAGGAGUUAAAAUGAAGGCAGGCUCGCUGGUUUGCUGAGAUCUGUCAGAGUCUGACUGGCUGGCUACAUAUCUGUCUCUGGAACAAUAGGUACCUGUAUUCUGCACGGACUGCUGGGCAGCACUAGCACUCUGGAGAAGGUCUGCCGCUGUCUGCACUUUCCUGGUUCUAUGCAGGCAGAUGAGUGUCACAGCUGUAACUGAGGCACAGAGCAGUACACACAGUGGAGCCGAUUUCCGCGAUGGCGAGAGGGGGCACCGGAGGUGACAACAAUAACAAGACUGUCCUUCGGACAAGUUUUAGAUUCUCAGGAUGAUGGAGUGAGUGAUGGAAUAGGUUGCCAACUGUAGUUACUCCACUCAGCACAGAAUGGCUGCGGGGAAAUAUAAUCAGACAUGCCCAAAGAAGUCUGCUUAGGGUGAAACAAAUACCUUUGAGGUUUAAAUCAGAAAGGAAGGAGAGACUGUUUCUACAGGUGUCAUACAAAAAUCAAUACUGAGCCAAGGAUUAUUGGAUCCCAUAGAACCACGGAGACUUGGUAGUGAAAUUCUUCCAAAGCAUUCCAUCCGUGCAGGCAGAUGGUGUUCCUAGGUUUGGAAAUAUAAAUCCCAUGGGAAGUCAGCUGAAGACCAUUUUAUGCAUCACUCAUCCUGUUAGAGCCCUGUGCUGUUCUGUCUCUCUAUAAGACUGGCUGAAACCACCACGGUUGUUUACAAUUUAUGCUCUAACUUUGGAUCACCUAGUUAAUACUCUAACUCCGAUUAUUACCAAAGACAAUGUUCUAUAAAAGAUAUUGUCUAUUAGAAGGAUGCUUCUGCAUUAUUAAUAAAAUCACAGGGAAAAUGCAACAUUUUGGAUGUCACAUCUGAUAAGUGGGUGACUGAUCGUACCCGCCAGCUGGCUAAUGUCAUAAUUAACAAAGUUGCUACUACAUCUGCAAAGUUUAAUCGAAAAAUUUGCCAGUGAUAUGAUGGCCUUGUCACAGAGAUCACAAGGGACACGGAGUUGACUUUUGCUCAAGGUGGAACGACAGAGCUGUGUAGGCAAGAUGAGAAAUUGCGAACUUGUUCGGCCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-307.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -329.00

Frequency: 0.0000

Diversity: 270.98

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((((...((((..((((((((..((.........((((((....(((((((.......(((((((((((......)).))).)))))).((((.(((((((.((((.((.((((((((((((((((..((((....((((..(.((.(((((((((((......)))))...........))))))..)).)..))))....)))))))))).).))))))))).))))))(((((((....((((.((((((((((((((((..(((.(((..(((((((....))).)))).))).)))...)))...........((((((((((...)))).))))))...(((((((((((((((((((((((((...((((........)))).)))))).))))).(((.((((((((((((.(((....(((.(((((............))))).))).((((.......))))(((((........)))))..(((((((((.(((((....))).)).)).............((((..((((((..((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))...)))))))...........))).))))).(((.(((..((((((((((((......))))))...)))))).))).)))....))))))).)))..)).))))))))..))))...))))))))))))).))))......)).))))).((((.....))))............((.((((....)))).)).)))))))..)))))))))))..))))))....((((((((((........))))))))))..((((((....))))))...................))..))))))))..))))....))))).)((.....(((((((........)))))))..((((((.(((......(((((.....((((..........))))...)))))......))).))))))..........((((((..........)))))).((((((..(((.((((((((...))))))).).)))..)))))).(((..((((((..........))))))..)))..))

Thermodynamic Ensemble Prediction

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