Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RMST_0003700
Sequence Length
1714 nt
GC Content
0.3961
GAAGAAUGACUUGGGCAAUACCAAAUGUUGAGUUAUCAAGUAUUUCGAUACCCAUAUGCAUCAUCUGCUGUAAGUGUAAGCAUCUUCUCAUUCUUAUAGAUUCUUUGAAUUACAUUAUAAAUGACUACCAUGUCAAUAGAUUAGAACAACAAUCGUGUCAUGGCUUUUUUGUCGUCAUGGGUCAUUUUCAUCAAAUGUUCAGUAAUUUCAUUGCACUGUGUAAUUAGGUGAAGAAACUCCACCCGAGCGUCCAUGGGUCAGCUAUGUGGACUCUAGCUGCCAAAGGCGCUUCUCCUUCUGAACAGAGCGCUUUGCUCAGCCAGUGUAGACAUGGCCUGAUAAACAAUGGAACUUCUCCCUUGAGAACUGGAGUUUGGAUUGAUCUAAUUCCUUAAUUCAAAAAUGUGCACAGGUUUGAUGAGUGGUUAAGAUGCCUGCCUUUUAGUGAAACAAGAGCUUAAAUUGACAGUACUGUGAAGAAUUCAGUAAUUUAUAAUGAACUUGAAAGGCAGUAGCACUCACUGUUGCAAAAGCUAAUCAAGGGACUAUCAAAUCAAAGUUUUUACAUGAGCUUAAAUAUCUGUGACAGGGAGGUUGUUCGUGCAGGUUUAUAUCUGUCAGAUCUUAACACUAAACCUGCCAGAGUGUAACAUGGUCCUGUCACUUUUAACCAAGAUGUCACAUAUAUUGUGGGAAACACGCUGCUCUGCAUUUUCUUUUCUAGGAUUUUACUAGGAAAAGCAAAUGUAAAAUAAAGUUUUUUUGUUUAUUUGUUUGCUUGUUGUUUUUUUUUUAACGCUACAUUUUUAUUUUGCAGAUUCUCAGGAUGAUGGAGUGAGUGAUGGAAUAGGUUGCCAACUGUAGUUACUCCACUCAGCACAGAAUGGCUGCGGGGAAAUAUAAUCAGACAUGCCCAAAGAAGUCUGCUUAGGGUGAAACAAAUACCUUUGAGGUUUAAAUCAGGAAGGAGAGACUGUUUCUACAGGUGUCAUACAAAAAUCAAUACUGAGCCAAGGAUUAUUGGAUCCCAUAGAACCACGGAGACUUGGUAGUGAAAUUCUUCCAAAGCAUUCCAUCCGUGCAGGCAGAUGGUGUUCCUAGGUUUGGAAAUAUAAAUCCCAUGGGAAGUCAGCUGAAGACCAUUUUAUGCAUCACUCAUCCUGUUAGAGCCCUGUGCUGUUCUGUCUCUCUAUAAGACUGGCUGAAACCACCACGGUUGUUUACAAUUUAUGCUCUAACUUUGGAUCACCUAGUUAAUACUCUAACUCCGAUUAUUACCAAAGACAAUGUUCUAUAAAAGAUAUUGUCUAUUAGAAGGAUGCUUCUGCAUUAUUAAUAAAAUCACAGGGAAAAUGCAACAUUUUGGAUGUCACAUCUGAUAAGUUGGCAGUUAAAGAACAGAAACAGCAAUAAGACUGCGUGGCUACAUUUUCCCAGUGCCACCAACUGGGAUUUAAGCUGACUAACAUUUUGAAAGCCCAGCCCAUUUCAUUCACAGCAGGAUGGCAGUGGGUGACUGAUCGUACCCGCCAGCUGGCUAAUGUCAUAAUUAACAAAGUUGCUACUACAUCUGCAAAGUUUAAUCGAAAAAUUUGCCAGUGAUAUGAUGGCCUUGUCACAGAGAUCACAAGGGACACGGAGUUGACUUUUGCUCAAGGUGGAACGACAGAGCUGUGUAGGCAAGAUGAGAAAUUGCGAACUUGUUCGGCCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-445.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -481.06
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.((...((((..........(((((((.(((...))).)))))))))))....)))).))((((((((((....(((..(((((((.(((...(((((...)))))..........((((......))))...((((........))))((.(((((((((...((((((.........((((((((.(((...((((...........))))....))).))))))))...((((((.(((((.((((..(((((((((((..((.((.((((...(((((((((.((.....))...)))))))))...)))).)).))..)))))).))))).....))))(((((((((((((.((.((((((((.(((....)))))))))............((((.((((((.((((.((((((......)))(((((((((((...............((((....(((((.........))))).....))))..)).)))))))))((((((.....)))))).............(((.((.(((((....((((........(((((((((....(((((((((..(((((((..(((((((((....................)))))))))..)))..))))....)))))))))............(.(((((.....))))).)..(((((.....(((((((.(((((((((.......))).)))))).)))))))(((((((.....)))))))....((((..(((((((((((((((((((((((..........(((((..(((((((((((((((((((((((((...((((........)))).)))))).))))).(((.((((((((((((.(((........(((((............)))))(((((((((.......)))).)))))..........(((((((((.(((((....))).)).)).............((((..((((((..((..(((.((.....)).)))..))..))))))))))...)))))))...........))).))))).(((.(((..((((((((((((......))))))...)))))).))).)))....))))))).)))..)).)))))))((((((((.(((((.(((((.(((..(((...)))..))).)))..)).)))))...............))))))))((((((((....(((((......)))))..))).....)))))(((((((((........)))))))))((((((...(((((....))))).))))))........)))))..)))))....(((((((...))))))).....)))).)))))))))..))))))))))..)))).)))))..........((((((.......))))))))))))))))))).....))))).))))).(((((((((((((......)))))).))))))).))).)))).))).((((((((((.(((......(((((.....((((..........))))...)))))......))).)))))).......))))..))))))).)).)).)))))))...))))))......)))))..)))))))))))))))))))).).))))))))))))..)))..)))))..))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.({,((...((((...,.,.{{{((((((....}))}.))})).)}),))))....)))).))((((({((((....(((..(((((((((((,,,(((((...)))}}..........((((......)))}.,.(({{.,......}})){{.{(((((({,.,,{(((({..,,,|,,.{(((((((.(((...((((.,......,..))))....))).))))))))...((((((.(((({,((((..(((((((((((..((.((.((((...(((((((((,{......},...)))))))))...)))).)).))..))))))}})))).....))))|((((((((((((.((.(((((({({(((....))))))))).....{{{{{..((.,..}},.}}}}}((((((,(,,....,.((((((((((((......,..,,,...,{{,,,,.{{{{|,.,,.....})))}.,,,....,..))}})))))))))}}})))))}{{{{.{{{,..{({.,{{,.(((,({,(((,,,,,{((({,,......(((((((({...,(((((((((..(((({((..(((((((((..,.{{..,,..........)))))))))..))}..))))....))))))))).......,,,||{|{((((.....))))}....(((((.....(((((((.(((((((((.......)))))))))).))))))}(((((((.....})))))),,.,((((..(((((((((((((((((((((((..,.......(((((..(((((.{(((((((((((((((((({,{((,(({{..{{.||{,.|||,||{{,|,|{((,,,,..{|||||,||||{........(((((.,........,.))))){||{(((((.......}}))},|||},......,,.(((((((((.(((((....)))},).)).........,,..,{{{,.((((((..((..(((.((.....)).)))..))..))))))}}},...)))))))...,,,..{{{||,{|}},,}),|}}}},}|((((({({{{(,.....))}}})},.)))))}.,))},))..)}))})))}.},)}})))))}|||,((((((((.(((((.(((((.(((..(((...)))..))).)))..)).))))),{{....}},.....)))))))).,{||||.....(({,,......}})))}}}}},,,..,,..((((((((((,,.....,)))))))))),,(({,,,{{{{|,,,.)}))}.,,,,,.........)))))..)))))....{((((((...))))))).,,},)))).))))))))}.,))))))))))..)))).))))).........{((((((.......)))))))}))))))),}.,.,.}}))))).}},,}.{((((((((((((......)))))).))))))},.,},}}.}},)))||{,{(((((.{((......{((({.....((((..........))))..,})))}......))}.)))))),...})})))),)))),)))))).)).)))))))...)))))}......,))))..))))))}))))))))))))).).)),,))))))))..)))..))))}..))))....)
Back