Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RMST_0004200
Sequence Length
1387 nt
GC Content
0.3828
GAAGAAUGACUUGGGCAAUACCAAAUGUUGAGUUAUCAAGUAUUUCGAUACCCAUAUGCAUCAUCUGCUGUAAGUGUAAGCAUCUUCUCAUUCUUAUAGAUUCUUUGAAUUACAUUAUAAAUGACUACCAUGUCAAUAGAUUAGAACAACAAUCGUGUCAUGGCUUUUUUGUCGUCAUGGGUCAUUUUCAUCAAAUGUUCAGUAAUUUCAUUGCACUGUGUAAUUAGGUGAAGAAACUCCACCCGAGCGUCCAUGGGUCAGCUAUGUGGACUCUAGCUGCCAAAGGCGCUUCUCCUUCUGAACAGAGCGCUUUGCUCAGCCAGUGUAGACAUGGCCUGAUAAACAAUGGAACUUCUCCCUUGAGAACUGGAGUUUGGAUUGAUCUAAUUCCUUAAUUCAAAAAUGUGCACAGGUUUGAUGAGUGGUUAAGAUGCCUGCCUUUUAGUGAAACAAGAGCUUAAAUUGACAGUACUGUGAAGAAUUCAGUAAUUUAUAAUGAACUUGAAAGGCAGUAGCACUCACUGUUGCAAAAGCUAAUCAAGGGACUAUCAAAUCAAAGUUUUUACAUGAGCUUAAAUAUCUGUGACAGGGAGGUUGUUCGUGCAGGUUUAUAUCUGUCAGAUCUUAACACUAAACCUGCCAGAGUGUAACAUGGUCCUGUCACUUUUAACCAAGAUGUCACAUAUAUUGUGGGAAACACGCUGCUCUGCAUUUUCUUUUCUAGGAUUUUACUAGGAAAAGCAAAUGUAAAAUAAAGUUUUUUUGUUUAUUUGUUUGCUUGUUGUUUUUUUUUUAACGCUACAUUUUUAUUUUGCAGAUUCUCAGGAUGAUGGAGUGAGUGAUGGAAUAGGUUGCCAACUGUAGUUACUCCACUCAGCACAGAAUGGCUGCGGGGAAAUAUAAUCAGACAUGCCCAAAGAAGUCUGCUUAGGGUGAAACAAAUACCUUUGAGGUUUAAAUCAGAAAGGAAGGAGAGACUGUUUCUACAGGUGUCAUACAAAAAUCAAUACUGAGCCAAGGAUUAUUGGAUCCCAUAGAACCACGGAGACUUGGUAGUGAAAUUCUUCCAAAGCAUUCCAUCCGUGCAGGCAGAUGGUGUUCCUAGGUUUGGAAAUAUAAAUCCCAUGGGAAGUCAGCUGAAGACCAUUUUAUGCAUCACUCAUCCUGUUAGAGCCCUGUGCUGUUCUGUCUCUCUAUAAGACUGGCUGAAACCACCACGGUUGUUUACAAUUUAUGCUCUAACUUUGGAUCACCUAGUUAAUACUCUAACUCCGAUUAUUACCAAAGACAAUGUUCUAUAAAAGAUAUUGUCUAUUAGAAGGAUGCUUCUGCAUUAUUAAUAAAAUCACAGGGAAAAUGCAACAUUUUGGAUGUCACAUCUGAUAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-345.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -374.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 351.80
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.((((((((......)))).(((((((.(((...))).))))))).(((..(((((..(((.(((((((.(((.(((((((.((((.......(((((...))))).......(((((((..(((((.(.(((((..((..(((((....)))..)).))..))))).).))))))))))))(((((((((.....(((((...))))).((((((((((((((.((.((((((((........(((((..(((((((((((..((.((.((((...(((((((((.((.....))...)))))))))...)))).)).))..)))))).))))).....)))))..(((((....))))).))))))))...)).))))))).................))))))))))))))))))))..))))))).))))))...((((..(((((((.((((((((((..((((((..(..((((((..((((((..((.(((((..(((.((((((.....))))))....)))..))))).(((.(((......((((((......))))))........(((((((((..(((((((..(((((((((....................)))))))))..)))..))))....)))))))))..........)))))).(((.((((.((((((.........((((((.....((((((((.......))))))))((((((((..(((((((.....)))))))...))))))))(((((((........))))..))).........)))))))))))).)))))))(((((((((((...((((........)))).)))))).)))))...((((((((((.((((((.........(((((............)))))..((((((((........(((((..(((....)))..))))).....((.(((((....))).)).)).........(((....)))((((((..((..(((.((.....)).)))..))..)))))).((((((((((((...(((...(((((.((....)).)))))..((((((((((((......))))))...))))))....))))))))..))))))).......))))))))......)))))))))))))))).))..))))))....))))))..)..)))))))))...))))))).))))).....))..))))..(((((......)))))..............((((((((((........))))))))))..((((((....))))))................)))))))..)))))......)))..))))..)))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((,(({{((((......)))}.{((((({.{{{,..})}.)))}))}.{{{..(((((..(((.(((({((.(((.(((((((.(((({{.....(({{,..,||||,.......(((((((..(((((.(.(((((..((..{,(({....)))..}}.))..))))).).)))))))))))),,{{,,{{{,},},{{{{{...|}}}}.(((((((,{{,((({{{.,,,||{||}}.{{,.,(((((..(((((((((((..((.((.((((...(((((((((,{......},...)))))))))...)))).)).))..))))))},)))).....))))).,,{|{|..,,||}},.,|||||||{{{.,.,)))))))}}....,}}}......)))))))))})))}))))))..))))))).)))))}.,,((((..(((((((.((((((({{{..((((((..{..((((((..((((((..{{.{{{((..(((,((((((,....}}}}))....}}|..}}}||,({{,.........{{((({......))))))..{{{{,{(((((((((..(((({((..(((((((((.,,,{{..,,..........)))))))))..))}..))))....))))))))).........})})))|{((,.|{{|}||{{{{....,,...{{{||{.....{(((((((.......)))))))|((((((({.,(((((((,...,))))))),,.,)))))))|({{(({........)))},.,,,.........})}}}}}|}}}}|}}}||}|(((((((((((...((((........)))).))))))}})))).(,((((((((((,((((((.....,,,.(((((.{........,.))))),||{(((((,.......,||{{({{,,,.....))}}}..(((((((((.(((((....)))},).)).........,,..,,{|,,((((((..((..(((.((.....)).)))..))..)))))),}}}...}))))))...,,,..{{{||,{|,,,,}},|}|||,,|((((((({{((......}}}}})}..)))))}.,,,,|}},|}}}}})))}.}))..,,.))))))))..},,,))))))))))))))))})}..))))))....))))))..}..))))))}}}...))))))).)))))....,))..)))}..{({((..,.,.}}}}}..}}.,,,,.....((((((((((,,.....,)))))))))).,{{{{{,{{{{|,,,,)})}}..,..,......)))))))..))))).,,,,,)}}.||}}}..}}),,,...
Back