Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RMST_0006400
Sequence Length
642 nt
GC Content
0.4112
GAUUAUUGGAUCCCAUAGAACCACGGAGACUUGGUAGUGAAAUUCUUCCAAAGCAUUCCAUCCGUGCAGGCAGAUGGUGUUCCUAGGUUUGGAAAUAUAAAUCCCAUGGGAAGUCAGCUGAAGACCAUUUUAUGCAUCACUCAUCCUGUUAGAGCCCUGUGCUGUUCUGUCUCUCUAUAAGACUGGCUGAAACCACCACGGUUGUUUACAAUUUAUGCUCUAACUUUGGAUCACCUAGUUAAUACUCUAACUCCGAUUAUUACCAAAGACAAUGUUCUAUAAAAGAUAUUGUCUAUUAGAAGGAUGCUUCUGCAUUAUUAAUAAAAUCACAGGGAAAAUGCAACAUUUUGGAUGUCACAUCUGAUAAGUUGGCAGUUAAAGAACAGAAACAGCAAUAAGACUGCGUGGCUACAUUUUCCCAGUGCCACCAACUGGGAUUUAAGCUGACUAACAUUUUGAAAGCCCAGCCCAUUUCAUUCACAGCAGGAUGGCAGUGGGUGACUGAUCGUACCCGCCAGCUGGCUAAUGUCAUAAUUAACAAAGUUGCUACUACAUCUGCAAAGUUUAAUCGAAAAAUUUGCCAGUGAUAUGAUGGCCUUGUCACAGAGAUCACAAGGGACACGGAGUUGACUUUUGCUCAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-151.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -164.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 203.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....))))(........((((((....(((.((((..............)))))))))))))((......))((((((((.((((((......))))))...((((.(((((((((((..(((....(((((.....((((((((((((((.(((((.(((((.(((..(((...)))..))).)))..)).)))))...............)))))))).(((((......(((....))).....)))))..........((((((((((........))))))))))......))))))....)))))............(((.(((((((((((((...(((((((...)))))))...))))((((((.....................)))))).......))))))))).)))........)))..))).)))))))).............))))(((((((((((((......)))))).)))))))...(((((((((..((((((((((.(((......(((((.....((((..........))))...)))))......))).)))))).......))))...)).))...)))))..)))))))).((((........))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((....}}}}(,...,..{({,({{..,,(((.{({{.....||,||,,,,||,.||{||}||}...||.|}}}|{{{((((.{{{{{{||....,,,,}}|..||||}(((((((((((..(((.,..,{(({.....{(((({((((((((.(((((.(((((.(((..(((...)))..))).))}..}).))))),{{....},,.....)))))))).,{||||.....((({{......}}}}),,}}..........((((((((((,,.....,))))))))))..,,,.|||||||...})))},...........{{{.(((((((((((((...(((((((...)))))))...))))((((((.....................)))))).......))))))))).)))........)))..))},}))))))}..,,.,.,,..,,}}|||{{{{{{{(((((......)))))).}||||||{.,...,,|}}}}}||||||||||,,{{.,....{{{{,...,,{{{{.....,..,.})||,.{||,,,....,.})),))}}||{{{.,,.||||,.|||}},...,}}}}}.))))}}}}.{|{{........))))..)
Back