Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RMST_0007500
Sequence Length
618 nt
GC Content
0.4693
UGGGUGACUGAUCGUACCCGCCAGCUGGCUAAUGUCAUAAUUAACAAAGUUGCUACUACAUCUGCAAAGUUUAAUCGAAAAAUUUGCCAGUGAUAUGAUGGCCUUGUCACAGAGAUCACAAGGGACACGGAGUUGACUUUUGCUCAAGGUGGAACGACAGAGCUGUGUAGGCAAGAUGAGAAAUUGCGAACUUGUUCGGCCAAAGGAGGCUAAUAAUGAAGGGGCCGGGAAGGAGGCCAGUGCUACCAGGGUUAUCUCACAACCUCAGAUGCUGGAUAAGUCGACGGAGGCAGAAUCGCUUUGGGAUGACAUUCAGAAAGCCUGGAGUGAUUACUUGCAAGAGAAAAGCCUACCUAUUCUUUCCAAGGUGCAGGAAUAUUCCCCUGACCUGCUCAUCCAGUGGUCCAGUAAUGAAUUACUGGAGACCUGCCUUAGACAAAGAAUGCACUCGGAGCCCCAACACACCUAAAGCCAUGCUUUGAAGGAUCUGCCAAGCUCACUUUUAAUCAUGAGAAAGAAAUUACCCACACGGAGUCAGCAGAAAAUGAGAAAGUAGAGCUCGUGCUGUGAAUAAUUCCAGCAAGUGCCAAGGGGCUAGUUGAGGAAUGGCUUCAUGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-162.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -175.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 168.00
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((........))))))(((...(((((.((((..............(((..........)))((((((.......))))))((((.........))))(((((((((.((.((....(...(((.((((........))))...)))...)....)).)).))).)))))).........(((((.((((((((((.....((((.............((((........))))..........(((....)))....))))....))))))))))))).))(((((((((((((((((((...............)))))))))))).......((((((.((.....)).))))))...((((.((((........))))))))..((.(((((((((.((....)).))))))))))).))))))).)))).........(((((((((((....(((.((((((...))))))..((.....)).(((((((((((..((((.........(((.((.....))))).........)))))))))).)))))..(((((.(((...)))))))).)))....))))))..)))))...)))))...)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({.{.....|))))))(({,{{(((,{,(.,,...{{{{{.....((((..........||||,.,||,,,......})},))}})},...,,.||||((((({{{{.{{.{{,,,,|}..({(.((((........))))..,))),..},.,,)}.)},}}|,||||}|,,,,,....,{((,{((((((((((.....((((........,..,.((((........}}))..,,,,.,,.{||,,..}}}....))))....))))))))))))).},{{{((((((((((((((((.,..,.....,....)))))))))))).,|||,.{(((((.((.....)).)))))).,.((((.((((........)))))))),}||.|{(((((((,((,,,.}}.})))))))),}.))))))).,,},.......,,(((({((((((..{,(,(,((((((...)))))}..||.....}}.(((((((((((..((((.........,,,.((,....)),)).........)))))))))).)))))..(((((.(({...}))))))).)))....))))))..}))}),..}))))}}.)).)
Back