Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RNF20_0000700

Sequence Length

450 nt

GC Content

0.4844

UUUGAUGAAAACAUCCGUAUCAUCCUUAAACGUUAUGAUCUGGAGCAGGGCUUGGGAGACCUACUCACAGAACGAAAAGCCCUUGUUGUGCCUGAACCAGAACCAGACUCUGAUAGCAAUCAGGAGCGUAAAGAUGACCGAGAGAGAGGGGAAGGGCAAGAGCCAGCUUUCUCUUUCCUUGCUACUUUGGCCAGCAGUUCCAGUGAAGAGAUGGAGUCUCAGCUGCAGGAACGUGUGGAGUCUUCCCGCCGAGCCGUGUCCCAGAUUGUGACUGUUUAUGAUAAAUUGCAAGAAAAAGUGGAGCUCUUAUCCCGGAAGCUAAACAGUGGAGAUAAUCUGAUAGUGGAGGAAGCAGUGCAGGAGCUGAACUCUUUCCUCGCACAGGAGAAUAUGAGGCUACAGGAAUUGACAGAUCUUCUUCAGGAAAAGCAUCGCACCAUGUCUCAGGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-131.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -139.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 89.69

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.....)))(.(((.(((((....(((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((.(.((.(((((.......))))).)).(((.........)))..((((((....)))))).((.(((((.....((((.((((((((((((((....)))..)))))))))))))))...))))))).....(((((.(((..(((((...)))))..).)).)))))).)))).)))))))....))))).))).)))))))))))).))))))))))..............((..((((((......)).))))..))...(((.....)))....((((((((((.(((.(((...))).))).))))))).)))..((((.((((..((........((((.(((...)))))))..........))..)))))))).))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.....)))(.(((.((({({,..(((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((.{.((.(((((.......))))).)){(((,..{{{....,,..||||{{....,))))}.((.(((((.,,..((((.((((((((((((((....)))..))))))))))))))).}.)))))))..,,.(((((.(({..(((((...)))))..),)).)))))}.)))).))))))),..,))))).))).)))))))))))).)))))}))),...,..........((..((((((......)),,)))..))..,{{{,,...}}}....((((((((((.(((.(((...))).))).))))))).)))..(((,,((((..((........((((.{({...}))))))..........))..)))))))).))))