Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-1079K10.3_0000100

Sequence Length

1013 nt

GC Content

0.5439

ACUUCUUCCUCUUCCUCCUCUGUGUCAUCAGAAUUCUCCCGGUCUUCCUUAACAGCAUGCACGUCAGACACUGCUCUUGUCUCCCUGAAAUAUGGCUGUUCUUCUGUUUCAUGGAGAUGCGGUUUGCUCAUCUUGGUGUCCACUAACACAGAAUAAGGACUUCCUGAUUCCCUUUUGUACACUUUGGUGGACAGGUCAAGUUCUUGGUUGGCACCAUGAUAAAAGGAAGAUGGCACUUGACCACGACGGCUAUCUUCUUGUGCCAUUCCUGCUACAUGCACAGCACAGUUUUCAACCAGCUCCUGACAAGAACUGGCUGUGUGGCUCAUUGGUAAGUGGCCCAAUUUAUUAAACAGUUCAGACUAUAAAGAAAUAGCUUUAAAACAAGGUAAUUAUUAAGACUCAAAUCUUUUCUCAUCCACAAAGAAUCACUCAAAUGAAAAAAAGAUAUUCCUGGAAACUGUGUGCAAUUCUUCCAGUGUUGCAGCACCAAAGCAUGAGUCAAAAAGGUUUGGUAUUAUGGCAAGAGCAGAGCACUAGUGAUUUUUCUUCUGAAGAGAGCUGCAAGGGACUUGGGAGCAUCUUAUCUUCCUUUAAGGCAAGCAAUGGUUCAUUCAGUGGCUUCAUGAACAAAACUCUUUCCACUUUAUAUUUGAUGAAGCUGAGAGAACAGUCACACCUCAGAGAUAUUGCCGGUUCGGCUCCAGACCACCGGGCCGGCCGCCUCCGCCUCCGCCGCCCCGGCCGCCGCCUCGGCGGUCCAUCCCUGCGGCGGGGGCCUGCAGCCGCGGCGCUCGAGUCACAACCGCCGGCUGGGCCAGCCCCUCCCCCCCUGCCCAACGUCUGUCCUCAGGGCCGCUCCUCAGACCCGGCCUCGGCCGCUGCCGCUGCCGCCGCAGCGCUACGUGGCCGCCGCUCCGACGUCUCGCGACUCCCUUCCCAGCGCGCGAGGGCGAGCGGGGCCGGCGGGGCGGGCAGCGCGGGGCGGGCGGCAGGGGAGGGGGUGUGCGUGU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-362.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -383.70

Frequency: 0.0000

Diversity: 222.62

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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