Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-115D19.1_0001600

Sequence Length

1193 nt

GC Content

0.3512

GUACAGAUACUUCAAUCACUGCUGAUGGAAGACUUCGAGAUACACUGUAAAAACUUUGAGAAAUGUCAUGACUGGGCACAUUGGAACUGAGCACUUGUACAGGAUGGAACAUCUGUCAGCAGAUCUCAAGAAACUGGGAGCAAAGAUAUUUCUUAGGCUUCAGGUUCGUAGUCUUGAUACCCUUCCUAAUAUUAGAAAAAUCAAAAAGACAGCACACACUGUUAGUAUAAGUUUCAAUUACGCAUCAGCACUGACAGCCAAUGAGAUAGGAAAUGGCUCCCCACUUACACUAAAAUUUACAAUCAAUGUUUUUGCAAAUAUUCUGCAGCAAAUAUUAUCUUAUUUUUAAUAGUUGUGUCUUUCUUGUCUGAUAUAAAAGUGAAUUACAGUAGUAGUCAGAGUUAAAAUAUCUAGGUUCUGAUCCGGAUGCACCAUUUAAUGAUCAUAUACCUAGUUUGGUAGGACAAAUAAGUUGGACUGUCUGGUUCUCAGUUUCUUCACCUGUAAAAUGUGAGAACAAAAUCAAGCUGUCUAUAAAGCCUUUUCCAGACUAAGAUGCUCUAAUUCUCAGAAGGAAAUUAAGAUGUUUGAAGGCAAGAUACAUUUUCCCUACUUUCACUCUCCCAGUUGAAAAUUUCGUCUUCAUCUAUGGCUUCAAUUAUUACUUGUAUUUCAAACCUCAAGCUCUCCAUACAGUAUCUGGAUAGCAUCCACAACACAAAUAUUAAUGGAUUUAAUUAAAGGGAUCAGAUUAUUCCUCCUAAAGAGCAACUCUAAUAAUAUCAGGAUUCUGCUUAAAAACAAACAAAUAAGCAUAACUUCAAUAACUCAAGUUGUUUUCUGAAUAGAAUACAAGCUGAAAUGACAAGAUUAUCCUAAUACUCUAUAACUUGUCUUUGACCCAUAGCUGCAAAUUCAAUCUAUCACCAUUUUCCUUGUUCCUAAGCUUGAGUCAUAAUUAUUCACUGUUCUCAGACAUAUCCAUUUGCAUGCUCAGACAUACAUGCCUUUGCUUCUGAUAUUCCCUUGUGCCAGAAUGUCCUCUGUUUGUUUUGACCUACUAUAUCUCUUACCUUUUCCCACCCAGAUCAACAUUACCUCCUCAAUAAAACUUCUCCUGAUUGAUUGAAACAGAUCUUUAAAAUGUUUUACUUUUUAGUAUGUCUUAUAUAUUUUUGCUCCUGUGAUGCCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-231.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -253.48

Frequency: 0.0000

Diversity: 244.01

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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