Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_RP11-192P3.5_0000100

Sequence Length

2542 nt

GC Content

0.6294

GUCCUGGCCAUGCCAUCGGCAACCUGCUCGUCUUGUCCGUGAGGCCUUCCCAGCUGGCCGGGCUCACCCUGCAGCUCCUGCACCUGUGCCUGCCCGGGGAAUUGUGGGCCGUUUCCCACUCCUCUUCAACCGUCAGCGACAUCUUGGGCCUUCUUUUCCAGUCAGGUGGGACGGCGCCCCUAUGAGGCUGUGUCUUAUCCCUCGGAACACGGGCACCCCACAGAGGGUCCUGCGUCCUGUGGUCUGGAGCCCCCCCUCAAGGAAGAAACCCGUGCUGUCUCCUCACAACUCCAUAAUGUUUGGACACCUCAGCCCCGUAAGGAUCCCUUGUCUCAGAGGCAAGUUUAACCUUCAACUUCCUUCAUUAGAUGAUCAGGUGAUCCCAGCCAGGCUCCCGAAGACGGAGGUGAGCGCAGAAGAGCCCAAAGAAGCAACAGAGGUGAAAGACCAGGUAGAGACCCAGGGGCAGGAGGACAAUAAAAGGGGCCCCUGUAGCAAUGGGGAAGCAGCCUCCACCUCUAGGCCCCUGGAGACUCAGGGAAACCUCACUUCUUCCUGGUACAAUCCCAGGCCCUUGGAGGGAAAUGUCCACCUCAAGAGCUUGACAGAAAAGAAUCAGACUGACAAGGCCCAGGUGCAUGCAGUGAGUUUCUACUCCAAGGGCCAUGGAGUCGCCAGUUCACACAGCCCUGCUGGAGGCAUCCUUCCCUUUGGGAAGCCUGACCCACUUCCAACAGUGCUCCCUGCCCCAGUUCCGGGCUGCUCCCUGUGGCCAGAGAAGGCGGCCUUGAAGGUGCUGGGUGAAGACCACCUGCCCAGCUCUCCAGGCUUGCUGAUGGUGGGGGAGGACAUGCAGCCCAAGGAUCCUGCAGCUCUUGGAUCAAGUAGGUCUUCUCCACCCAGAGCUGCCGGCCACAGGUCCCACAAAAGAAAACUGUCGGGGCCACCGCUGCAGCUGCAACCGACCCCUCCCCUGCAACUGAGGUGUGAUAGAGACGAGCGGCCCCCACCGGCAAAGCUUCCAUGUCUAUCUCCUGAGGCACUGUUGGUGGGUCAGGCUUCCCAAAGAGAAGGACGCCUCCAGCAUGGCAACAUGCGUAAGAACAUGAGAGUGUUAAGUAGAAUAUCAAAAUUCAGGAGACUAAGACAGUUGCUUAGGAGGAGAAAGAAGACACGGCAGGGCAGGCGUGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCAGCACUUUGGGAGGCCCAGGCGGGCGGAUCAGGAGAUCAAGAGAUUGAGACCUGAGGAGCAUCUCUGCCUGCACCAUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCUCUGCCCUGCUGCUCCACCAUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCUGUGCCCGGCCACCGCACCAUCUGGGCAGUGAGGAGCGCCUCUGCCCGGCCCCCGCCCUGUCUGGGAAGCGACAAGAGCCUCUGCCCAGCAGCCUCACAGUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCUCUGCCCAGGCCCUGCCCCGUCUGGGCAGUGAGGAGUGCCUCCGCCAGGCCGCCGCCCUGUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCUCUGCCCAGCCACCGUCCCGUCUGCGAAGCGAGGAGUGCCUCUGCCCGGCCCCCCUACACUCUGGGAAGCGAGGAGUGCCUCUGCCCGGCCCCCCUACACUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCUCUGCUCGGCCACCGCCCCGUCCGGGAAGUGAGGCGCGCCUCUGCCCAGCCGCCCACUAUCUGGGAAUUGAGGAGGAGCGCCGCCUCUGCCUGGCCUCCACCCCAUCUGGGAAGUGAGGAGCACCUCUGCCCAGCUGCCUCACAGUAUGGGAAGUGAGAAGCGCCUCUGCCCAGCCGCCGCCCCAUCUGGGAAACAAGGAGCGCCUCUGCCCCGCCGCCGUCCUGUCUGCGAAGUAAGGAGUGCCCCUGCCCGGCCUCCUCACCGUGUGGGAAAUGAGGAGCGCCUCUGCCCCGCCGCCGCCCCGUCUGCGAAGCGAGGAGUGCCUCUGCCCAGCCUCCUCACCGUCUGGGAAAUGAGGAGCGCCUCUGCCCUGCCGCCGUCCCGUCUGCGAAGCGAGGAGUGCCUCUGCCCGGCCUCCUCACCGUCUGGGAAAUGAGGAGUGCCCCUGCCUUGCCGCCGUCCCGUCUGCGAAGCGAGGAGUGCCUCUGCCCGGCCUCCUCACCGUCUGGGAAAUGAGGAGCGCCUCUGCCCUGCUGCCGUCCUGUCUGUGAAGUGAGGAGUGCCUCUGCCUGGCCUCCUCACCGUCUGGGAAAUGAGGAGCGCCUCUGCCCGGCCACCGUCCCAUCUGGGAAGUGAGGAGCGCCCCUGCCCAGCCGCCGCCCUGUCUGGAAAGUGAGGAGCACCUCUGCCCAGCCCCCUCACCAUUUGUAAGGGAGGAGUGCCUCUGCCCAGCCCCUGCACCGUCUGGGAAGUGAGGAGUGCCCCCACCCGGCCCCCUCACCAUCUGGGAAGUGAGGAGGGUCUCUGCCUGGCUGCUGUGCAACCUUCCAAGUGUGAAGUGACAGCCUUGUGUGUGAUCUUUCUGCCCUCCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1070.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1110.32

Frequency: 0.0000

Diversity: 518.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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