Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RP11-732M18.3_0001500
Sequence Length
525 nt
GC Content
0.3695
UCCUGGGUCAAGCUGAGUAUCUCCACGUUUAGGUGCACAAAUACUAUUUUGUGAAGAUCUUAAAUUUGUGGUAUAAGAACUUGAAGGAAAUAGAACUGAUUUGUUACUUCUAAAAGGUAAGCUUUUGAUAAGUGAAUAUGAAUUCCCUCUAAGAACUAGAUGAUAUAAAUCAUUGCUGAACCCCAAACUAAUGUUCAUUAUGUCCAGCUGUGAUUAUAACCUUUGACUGAAAUGUGGGUUAAGGGGACAUUUGGAUCAUUAUCUUUUUUCCUGCUACCCGGUGUCUACUCUUUGAUUUGAGGUAAUGCUAGUUUCUGGGAAGAACGGCUACGAGAUUUAAAUCCUGCCAUUAAUUUUCUCAUGUUAUAUUUGUGUACCUAUAGGGCAUGGUAGUAGUCAAGAAUCAACUGAAUUUUCCCUGACAGUUUUUAUUCUUGUUGGUGUUAAUUGUAAUAACACCUGUGUAAAGCAGGCAUCUGGAUCUUCCAGGACCACAGAUGCUUUCUUGAUGAACCCCAUGUCAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-122.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -133.10
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.95
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((((((((..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((.(.(((.(((((.(((...))).))))).)))..).)))))))(((......)))((((.((((((.....))))))..)))).(((((((.(((((.....(((((((........((((((.((((.((....(((....)))......)).)))).))))))....(((((((((........)))))))))((((((.((......................)).))))))..(((........)))......)))))))..)))))....(((...((........))..)))..........))))))).))))))))))))))...))).))).......(((((((.(((((............)))))...)))))))..(((((((.......)))))))(((.....)))((..((((((...)))))).))..)))))))).))))).....)))).).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(.(((((({{{.,(({((({,{{{.{{{(((((((((((((((((((((.(.(((.(((((.((,...,)).))))).))).,,.))))))).,,......}|{((((.{(((((.....))))))..))))}{((((({.{((((....,(((((((....{{{,((((((.((((.((....(((....)))......)).)))).))))))}}}.(((((((((.,....,.)))))))))(((({{.((,.,...........,..,,...}}.}))))),,({(........)))}},...))))))},})))))....(((...({,,......))..)))..........))))))}.)))))))))))))).,,))|.||}..,,,,,(((((((.(((((............)))))...)))))))..(((((((.......))))))),{{.....|}|(({{(((((.{{{.,,,))}.).})))))))).)))}),....)))).).....
Back