Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RTN4_0002100
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4040
GUCAGGAGUUUGAGACUAGCCUGGCCAACAUGGAGAAACCCCGUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGCAUGCCUGUAAUCCCAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGACUACAGGUGUCCGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGAAGAGAUGGGGUUUUGCCAAGUUGGCCAGACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-121.77 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -123.36
Frequency: 0.0752
Diversity: 4.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..........)))(((.(((((((((.(((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((((.(((((((.................................................................))))))).))))))))).))))))))))))..))))).)))))))))))))).)))))))))))))).))).))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..........)))(((.(((((((((.(((.((((((((((((((.(((((((((((((((((((..((((((((((((.(((((((((.(((((((.................................................................))))))).))))))))).))))))))))))..)))))))))))))))))))).)))))))))))))).))).))))))))).)))
Back