Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_RTN4_0003100
Sequence Length
305 nt
GC Content
0.4525
UGGUGUUUGGUGCCAGCCUAUUCCUGCUGCUUUCAUUGACAGUAUUCAGCAUUGUGAGCGUAACAGCCUACAUUGCCUUGGCCCUGCUCUCUGUGACCAUCAGCUUUAGGAUAUACAAGGGUGUGAUCCAAGCUAUCCAGAAAUCAGAUGAAGGCCACCCAUUCAGGGCAUAUCUGGAAUCUGAAGUUGCUAUAUCUGAGGAGUUGGUUCAGAAGUACAGUAAUUCUGCUCUUGGUCAUGUGAACUGCACGAUAAAGGAACUCAGGCGCCUCUUCUUAGUUGAUGAUUUAGUUGAUUCUCUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-75.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -82.14
Frequency: 0.0000
Diversity: 82.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.((.(((......((((((.......).)))))....(((.((((.((......)).)))).)))...)))(.(((..((((((((((..(((....((((((((....)))).))))........((((..(((((((...(((..........))).)))))))..)))).(((((((((.((((((.......)))))).))..)))))))..)))..)))))))).))...))).).....)).)).)))))))).((((..(((((((......)))))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((({.((,{{,......((((({.......|,}}}}}....(((.((((.((......)).)))).)))..,}}},.{{{,.{{,(((((((..((({,..((((((((....))))}}))),}}},...((((..(((((((..,(((.........,))).)))))))..)))).{{{{(((,{.((((({.......)))))).}},.|}}}}},,,)}}..)))))))},)}...))).}.....)).}).)))))))).((((..(((((((......))))))}....))))
Back