Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SATB2_0001200
Sequence Length
316 nt
GC Content
0.5949
GGCUGGCUGUGUGAACUGCUCCGCUGGAAGGAGAACCCAAGCCCAGAAAACCGCACCCUCUGGGAAAACCUCUGUACCAUCCGUCGCUUCCUGAACCUUCCCCAGCAUGAGAGGGAUGUCAUCUAUGAGGAGGAGUCAAGGCAUCACCACAGCGAACGCAUGCAACACGUGGUCCAGCUUCCCCCUGAGCCGGUGCAGGUCAGUGUCCCCGACCGCCGUACCCCACCUGAUCAGGGCUCUGUGUGCCAGCAGUAGCUGCUGAGGGUCCAAGUGGCACACACCACACCAACUUCUGUCAGAGGGUGUCUCAUGCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-95.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -101.20
Frequency: 0.0001
Diversity: 81.63
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((.((....)).))))).((((...((((((((.....(((((....((((((((.(((((.(((.((((..(((.(((((((.(((..(((((((.((..((((.(....).))))...)).))))).))..))).........)))).))).)))..))).).))).....)))))...)))..))))).((((((.((.....((....)).....)))))))).(((((((......((((((...)))))))))))))..((((......))))......))))).....)))).))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{((,.({....}}.,||{|.,,,,..}|||.,,}}.,}}}(.{......(((((((((((((,.{((.((((..(((.(((((((.(((,.{{(((((.((..((((.{....).))))...)).))))).}),.})).........)))),,)).)))..))).).))).,...,,,,((((((.{.((((..((((.((({{...}},})).).))).)))).}.))))))...((((((((({{{{...||}},,.,},,.....})))))))}.,,|.........},,)))))))))),,,...}},)
Back