Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SATB2_0001400

Sequence Length

882 nt

GC Content

0.4512

UUGCAAGAGAGAGAACAUCCGGAUGCCAGAUUUUGGAAGCAGACAUUUGCAGGUGUGACCUGACCAACUGCCUACCUUCCUGCAGGUGUGGCUGUUGCGGGAAGGUGAUGGUUAAGAGGGCCUAGAGCCCGAGGUAUUCAGAGAUUGAGCAAAUAUACAUUUCUUUUCAUUCUAGCCAAGGUUGUUGCUUCUAUUUUGUGGAGUUAUUGAUAAUUUUAAGAAUAUUUCCUCCCUAGAGAAUUCAGUGUUGUUUACACCUAGACAAUUUUUCUUUUUUAGAAUUUGCUGUCCUGUUAUGCAUAUUUGUUUAUCUUCACUCUUAGCAUGAAAUGCUGCCCAGUUGGGUAAUUUUAAAAAAUUGUAGCUGACUGACACAAAUUACUUUUUCUGAGAACAGAUGACUAUAAUCUUGCUAAUCUUUUACAGAGAAACUGCAAUUGAGAAUAUAUUCUAUAGGCAGGGUGAUACGAUAUCUAACAAGAGGAAAGAUUCUUGGGCAUUGGUAUAACCACCUAUGUGGUCAGGGGUUGGUUUUUAGAGUCAGACUGUUUCACUAUCUCCCCACGUUGGCAGGAACAAUUUUGACAGAAAAAGAUGUACUGUGAUGGCACUGGACCGCAGUCAAGGCCCCCUCAGCUCCUCUACACUCUGCAGGUUAAUGCAAGCGACCUCCUCUCUCUACAGGGCUGGCUGUGUGAACUGCUCCGCUGGAAGGAGAACCCAAGCCCAGAAAACCGCACCCUCUGGGAAAACCUCUGUACCAUCCGUCGCUUCCUGAACCUUCCCCAGCAUGAGAGGGAUGUCAUCUAUGAGGAGGAGUCAAGGCAUCACCACAGCGAACGCAUGCAACACGUGGUCCAGCUUCCCCCUGAGCCGGUGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-238.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -255.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 255.45

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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