Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SATB2_0013800
Sequence Length
250 nt
GC Content
0.4200
UUGGACGGCUCUCUUGAAUAUGACAACAGAGAAGAACACGCCGAGUUUGUCCUGGUGCGGAAAGAUGUGCUUUUUAGCCAGCUGGUGGAGACUGCGCUCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAGCUCAGCUCACUCCUGCUGUCACACAAGCUCCCUCCUAAGUCAUUAGAGUGCUGGCAUGGACUCUUUCCGGAUCAGUCAGAGAUGCAUUAGGAGAGGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-55.29 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -58.89
Frequency: 0.0029
Diversity: 32.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((.((((((.............))).))).).)))))).(((.((((((((((((((((.((.(......((((((.((.((((.(((.(((.....................................................))).)))))).).)).(((........)))...(((.(((....)))))).))))))..).)))))))))..(((.......)))))))))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(({.((((((,...........,)))},)}.}.)))))).(((.((((((((((((((((.((.(......((((((.((.((((.(((.(((.....................................................))).)))))).).)).(((,.......)))...((,{(((....)))))).))))))..).)))))))))..{((.......)))))))))))).))).
Back