Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SCMH1_0006400
Sequence Length
371 nt
GC Content
0.5687
GAGCCACCAUCGCCUUCCCACAACUUCUUCAAAAUGGGAAUGAAGCUAGAAGCUGUGGACAGGAAGAACCCUCAUUUCAUUUGCCCAGCCACUAUUGGGGAGGUUCGGGGCUCAGAGGUGCUUGUCACUUUUGAUGGGUGGCGAGGGGCCUUUGACUACUGGUGCCGCUUCGACUCCCGAGACAUCUUCCCUGUGGGCUGGUGUUCCUUGACUGGAGACAACCUGCAGCCUCCUGGCACCAAAGAGGAAACCUCGGACUUUGCUGAACCCACCACCUGCCUCACCAACAACCAGCACUCCUGAACCGGAUACCAGCACUGUACCCCAGGAUGCUGCCACCAUCCCCAGCUCAGCCAUGCAGGCCCCAACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-115.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.52
Frequency: 0.0001
Diversity: 109.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..(((.((....(((((.(((((.....((....))......))))).)))))..(((......)))..........((((((((.(.((.((((((((((((((.((.((((((((((((((((.....))))))))))(.(((..........))).))))))))).))))))...)))))))).))))))))).))....(((((((.((......(((((.((((((.......((((...))))((((..(((((...........(((..............))).(((......)))...)))))..)).)))))))).))))).....)).)))).))))).)))..))).)(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((.,(({.(({{,,((({{.(((((,,....,..,,,,,,.,.,}}}}|,||}||.,{(({{{,...,|,..,,,....|{((({{{.|,,,,|(((((({((((((,(({(((((.((((((((((.....))))))))))|.|||}}}},.....}}|,}}}}}}}}}.})))))}..,))))))),}}}))))))|}},,,,{((((((.((......(((((.((((((.......((((...))))((((..(((((...........(({..............))}.(((......))}...)))))..)).)))))))).))))).....)).)))).))))}.)))..))).){....)
Back