Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SCMH1_0009900
Sequence Length
333 nt
GC Content
0.5345
GAUUUCGGCUGAAUGCGUCUUCUUGGCCCAUGUUCCUUUUGAAGACGCUAAAUGGAGCAGAGAUGGCUCCCAUCAGGAUUUUCCACAAGGAGCCACCAUCGCCUUCCCACAACUUCUUCAAAAUGGGAAUGAAGCUAGAAGCUGUGGACAGGAAGAACCCUCAUUUCAUUUGCCCAGCCACUAUUGGGGAGGUUCGGGGCUCAGAGGUGCUUGUCACUUUUGAUGGGUGGCGAGGGGCCUUUGACUACUGGUGCCGCUUCGACUCCCGAGACAUCUUCCCUGUGGGCUGGUGUUCCUUGACUGGAGACAACCUGCAGCCUCCUGGCACCAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-117.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -123.72
Frequency: 0.0001
Diversity: 44.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(((((...((((((((..((........))....)))))))).....(((((.......)))))...((((..((((((((((((((.((((..((((..(((((.(((((.....((....))......))))).)))))(((((((((...(((............(((......)))(((((..(((((((((((((((.((((((((((.....))))))))))..))))))))...........)))))))))))))))...)))).)))))))))))))))))))))..))))))...)))))))))))((........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....(((((...((((((((..((........))....)))))))).....(((((.......)))))...((((..((((((((((((({,((((..((((..(((((.(((((,,....,....,},,....))))).)))))(((((((((...(((..........({(({......,))||{|(|,(((((((((((((((.((((((((((.....)))))))))),.)))))))).....,,...,)))))))}}))})))...))))))))))))))))))))))))))..))))))...)))))))))))((........))
Back