Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SFMBT2_0014200
Sequence Length
336 nt
GC Content
0.5417
AAGAAGGCUCAAGCUUGGAGGAAACUGGCUUUAACUGGGGAGAAUAUUUGGAAGAGACAGGAGCAAGUGCUGCUCCCCACACAUCAUUCAAACACGUUGAAAUCAGCAUUCAGAGCAACUUCCAGCCAGGAAUGAAAUUGGAAGUGGCUAAUAAGAACAACCCGGACACGUACUGGGUGGCCACGAUCAUUACCACGUGCGGGCAGCUGCUGCUUCUGCGCUACUGCGGUUACGGGGAGGACCGCAGGGCCGACUUCUGGUGUGACGUAGUCAUCGCGGAUUUGCACCCCGUGGGGUGGUGCACACAGAACAACAAGGUGUUGAUGCCGCCGGACG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-105.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -110.22
Frequency: 0.0005
Diversity: 75.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((....))))........(((((......((((((((.((((((.............)))))).).)))))))..(((((.....((((.(((..............(((.((((((((.((....))...)))))))).)))..........((((((.......))))))((((..............(((((((.(((....))))))))))..((((((((........))))))))))))....((((..(((((...)))))..))))..((((((((....)).))))))..........))).)))))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,(((..,.||||,..,....{{{({|,....(((((((..((((((.............)))))).}.)))))))....,,..,,.,,,,,,{||,..,||||.,,...(((.{(((((((.({....))...)))))))).)))..........((((((.......)))))){{({.,............(((((((.(((....))))))))))..((((((((........))))))))))))....{(((,,(((((...))))),,)})}..((((((((....)).))))))..........|,..))))))))},,)))}}...
Back