Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHKBP1_0000100

Sequence Length

235 nt

GC Content

0.6426

GGGUGCACACCCGGAAGUGGGUGCGGGCCAGCCGGCUCGCCCGGGGGCCAUGGCAGCAGCGGCUACUGCAGCCGAGGGGGUCCCCAGUCGGGGGCCUCCCGGGGAAGUCAUUCAUCUGAAUGUGGGAGGCAAGAGAUUCAGUACCUCUCGCCAGACUCUCACCUGGAUCCCAGACUCCUUCUUCUCCAGUCUUCUGAGCGGACGCAUCUCGACGCUGAAAGAUGAGACCGGAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-96.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -100.21

Frequency: 0.0040

Diversity: 54.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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