Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHKBP1_0000500

Sequence Length

467 nt

GC Content

0.5931

AUCUUCAUCGACAGGGACCCUACAGUCUUCGCCCCCAUCCUCAACUUCCUGCGCACCAAAGAGUUGGAUCCCAGGGGUGUCCACGGUUCCAGCCUCCUCCAUGAAGCCCAGUUCUAUGGGCUCACUCCUCUGGUUCGUCGCCUGCAGCUUCGAGAGGAGUUGGAUCGAUCUUCUUGUGGAAACGUCCUCUUCAAUGGUUACCUGCCGCCACCAGUGUUCCCAGUGAAGCGGCGGAACCGGCACAGCCUAGUGGGGCCUCAGCAGCUAGGAGGACGGCCAGCCCCUGUCCGACGGAGCAACACGAUGCCCCCCAACCUUGGCAAUGCAGGGCUGCUGGGCCGAAUGCUGGAUGAGAAAACCCCUCCCUCACCCUCAGGACAACCUGAGGAGCCGGGGAUGGUGCGCCUGGUGUGUGGACACCAUAAUUGGAUCGCUGUGGCCUAUACCCAGUUUCUAGUCUGCUACAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-163.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -173.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 142.86

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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