Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHKBP1_0000700

Sequence Length

2056 nt

GC Content

0.6240

GGGUGUCCACGGUUCCAGCCUCCUCCAUGAAGCCCAGUUCUAUGGGCUCACUCCUCUGGUUCGUCGCCUGCAGCUUCGAGAGGAGUUGGAUCGAUCUUCUUGUGGAAACGUCCUCUUCAAUGGUUACCUGCCGCCACCAGUGUUCCCAGUGAAGCGGCGGAACCGGCACAGCCUAGUGGGGCCUCAGCAGCUAGGAGGACGGCCAGCCCCUGUCCGACGGAGCAACACGAUGCCCCCCAACCUUGGCAAUGCAGGGCUGCUGGGCCGAAUGCUGGAUGAGAAAACCCCUCCCUCACCCUCAGGACAACCUGAGGAGCCGGGGAUGGUGCGCCUGGUGUGUGGACACCAUAAUUGGAUCGCUGUGGCCUAUACCCAGUUUCUAGUCUGCUACAGGUUGAAGGAAGCCUCUGGCUGGCAGCUGGUGUUUUCCAGCCCCCGCCUGGACUGGCCCAUCGAACGACUGGCGCUCACAGCCCGGGUGCAUGGUGGGGCUUUGGGUGAACAUGACAAGAUGGUGGCAGCAGCCACCGGCAGCGAGAUCCUGCUAUGGGCUCUGCAGGCGGAAGGCGGUGGCUCCGAGAUAGGGGUCUUUCAUCUGGGGGUGCCUGUGGAGGCCUUGUUCUUCGUCGGGAACCAGCUCAUUGCUACAAGCCACACAGGGCGCAUCGGGGUGUGGAAUGCCGUCACCAAGCACUGGCAGGUCCAGGAGGUGCAGCCCAUCACCAGUUAUGACGCGGCAGGCUCCUUCCUCCUCCUGGGCUGCAACAACGGCUCCAUUUACUACGUGGAUGUGCAGAAGUUCCCCUUGCGCAUGAAAGACAACGACCUCCUUGUCAGCGAGCUCUAUCGGGACCCAGCGGAGGAUGGGGUCACCGCCCUCAGUGUCUACCUCACCCCCAAGACCAGUGACAGUGGGAACUGGAUCGAGAUCGCCUAUGGCACCAGCUCAGGGGGCGUGCGGGUCAUCGUGCAGCACCCGGAGACUGUGGGCUCGGGGCCUCAGCUCUUCCAGACCUUCACUGUGCACCGCAGCCCUGUCACCAAGAUCAUGCUGUCGGAGAAGCACCUCAUCUCAGUCUGUGCCGACAACAACCACGUGCGGACAUGGUCUGUGACUCGCUUCCGCGGCAUGAUUUCCACCCAGCCCGGCUCCACCCCACUCGCUUCCUUUAAGAUCCUGGCUCUGGAGUCGGCAGAUGGGCAUGGCGGCUGCAGUGCUGGCAAUGACAUUGGCCCCUACGGUGAGCGGGACGACCAGCAAGUGUUCAUCCAGAAGGUGGUGCCCAGUGCCAGCCAGCUCUUCGUGCGUCUCUCAUCUACUGGGCAGCGGGUGUGCUCCGUGCGCUCCGUGGACGGCUCACCCACGACAGCCUUCACAGUGCUGGAGUGCGAGGGCUCCCGGCGGCUCGGCUCUCGGCCCCGGCGCUACCUGCUCACUGGCCAGGCCAACGGCAGCUUGGCCAUGUGGGACCUAACCACCGCCAUGGACGGCCUCGGCCAGGCCCCUGCAGGUGGCCUGACGGAGCAAGAGCUGAUGGAACAGCUGGAACACUGUGAGCUGGCCCCGCCGGCUCCUUCAGCUCCCUCAUGGGGCUGUCUCCCCAGCCCCUCACCCCGCAUCUCCCUCACCAGCCUCCACUCAGCCUCCAGCAACACCUCCUUGUCUGGCCACCGUGGGAGCCCAAGCCCCCCGCAGGCUGAGGCCCGGCGCCGUGGUGGGGGCAGCUUUGUGGAACGCUGCCAGGAACUGGUGCGGAGUGGGCCAGACCUCCGACGGCCACCCACACCAGCCCCGUGGCCCUCCAGCGGUCUCGGCACUCCCCUCACACCUCCCAAGAUGAAGCUCAAUGAAACUUCCUUUUGAACAACGCAGCUGCCAUGAUGCCUUGGGAUGCCCUGGUCCUGGGGGACUCAGGUGCCUCCCUGAUUCCUGUGGGAACCCCGGGUUCAGGGCCAGGGCCUCCUUGGAAUAAAUGGUUAUUGUUACUAGGUCCCCACCUUCCCUCUUUUCUGGAAGCCAAAGUCACCCUCCCCAAUAAAGUCCUCACUGCCAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-872.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -906.27

Frequency: 0.0000

Diversity: 361.35

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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