Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SHPRH_0004700

Sequence Length

2477 nt

GC Content

0.4380

GCUGCAGAAAUGGCCCAGCGUUUGAGUGGGAUUAAUCGAUGGUGUAUCAGUGGCACUCCAGUACAGAGAGGAUUAGAGGAUCUUUUUGGGUUAGUGGUCUUUCUUGGUAUUGAACCUUACUGUGUCAAACACUGGUGGGUUCGACUUCUCUAUCGGCCUUACUGCAAGAAGAAUCCUCAGCAUCUCUACAGCUUUAUUGCCAAGAUACUGUGGAGGUCUGCAAAGAAAGAUGUGAUUGACCAAAUCCAAAUACCACCACAAACCGAAGAAAUACACUGGCUCCACUUUUCUCCAGUGGAAAGGCAUUUCUAUCACCGUCAGCAUGAGGUGUGCUGCCAGGAUGUGGUGGUAAAACUCAGGAAGAUUUCUGACUGGGCUCUGAAGCUCAGCAGCCUAGACAGAAGGACUGUCACCUCUAUCCUGUAUCCAUUGCUGAGGCUCAGACAGGCCUGCUGUCACCCACAGGCUGUUCGUGGAGAGUUCUUGCCACUCCAAAAAAGUUUUGAACAGUCUACCUUUUCUUUUAGCACCAUGACAAUGGAAGAGCUGCUGACAUCUUUGCAGAAGAAAUGUGGAACUGAAUGUGAAGAAGCACAUCGACAGCUAGUUUGUGCUCUCAAUGGCUUAGCAGGCAUUCAUAUUAUUAAAGGUGAGUAUGCCUUGGCAGCAGAAUUGUACAGAGAAGUGUUGCGCUCCUCGGAGGAACACAAAGGAAAACUCAAAACUGAUUCACUUCAAAGACUUCAUGCUACCCAUAACUUGAUGGAAUUGUUGAUAGCCAGGCACCCAGGGAUACCACCUACCUUGCGUGAUGGCCGACUUGAGGAAGAGGCCAAACAGCUGCGAGAGCACUACAUGAGCAAGUGUAAUACAGAAGUUGCUGAAGCCCAGCAAGCUUUAUAUCCUGUGCAGCAGACCAUCCAUGAGCUUCAAAGAAAGAUUCAUUCUAAUUCUCCUUGGUGGCUAAAUGUGAUCCACAGAGCAAUAGAAUUUACUAUUGAUGAGGAGCUAGUUCAGCGAGUGCGAAAUGAAAUAACCAGCAACUACAAGCAACAAACUGGCAAGCUUUCUAUGUCAGAGAAAGGUCUUCAGUUCUUACUUACAACACAAAUGGAAGAGCUAAAUAAAUGCCAGAAGCUAGUAAGAGAGGCUGUAAAAAACCUGGAGGGACCUCCAUCUCGUAAUGUUAUUGAGUCUGCAACAGUCUGUCACCUCCGACCAGCCAGACUUCCUCUCAACUGCUGUGUCUUUUGUAAAGCUGAUGAAUUGUUCACAGAGUAUGAAUCAAAGCUAUUUUCCAACACAGUCAAAGGCCAGACUGCAAUAUUUGAGGAGAUGAUAGAAGAUGAAGAAGGACUGGUGGAUGAUCGAGCACCUACCACCACCCGGGGUCUCUGGGCAAUAAGUGAGACAGAGCGAUCUAUGAAAGCAAUACUAUCAUUUGCAAAAUCACAUAGGUUUGAUGUUGAAUUUGUUGAUGAAGGAAGCACUUCAAUGGAUCUCUUUGAAGCAUGGAAGAAGGAAUAUAAGUUGCUUCAUGAAUAUUGGAUGGCUCUGAGGAAUCGUGUGUCUGCUGUUGAUGAACUUGCAAUGGCUACAGAACGACUAAGAGUGCGUGAUCCUAGGGAGCCAAAGCCUAAUCCGCCUGUUCUUCAUAUCAUUGAACCACAUGAGGUAGAACAAAACCGAAUAAAACUACUAAAUGAUAAAGCUGUUGCUACAUCACAGCUUCAGAAAAAACUUGGGCAGCUUCUUUACCUAACUAAUUUGGAGAAGUCUCAAGAUAAAACAUCGGGAGGUGUUAAUCCAGAACCUUGCCCAAUCUGUGCUCGACAGCUAGGAAAACAGUGGGCGGUACUGACCUGUGGUCACUGUUUCUGUAAUGAAUGCAUUUCUAUAAUUAUUGAACAAUACAGCGUGGGAUCUCACAGAAGCUCCAUUAAGUGUGCAAUCUGCCGCCAGACCACAUCUCACAAAGAAAUCUCGUAUGUCUUUACCUCAGAGAAAGCAAACCAGGAGGAGGACAUCCCUGUGAAGGGCAGCCAUUCUACAAAAGUGGAAGCUGUGGUCAGAACUCUGAUGAAAAUACAGCUUAGAGAUCCAGGGGCCAAAGCACUCGUUUUCUCAACGUGGCAAGAUGUAUUAGAUAUUAUUUCAAAAGCUCUUACUGACAACAACAUGGAAUUUGCACAAAUCAGUCGUGUUAAGACAUUUCAGGAGAACCUUUCAGCAUUUAAACGUGAUCCCCAAAUCAAUAUUUUGCUGCUGCCCCUGCACACAGGUUCUAAUGGAUUAACUAUCAUUGAAGCAACUCAUGUUCUCUUGGUGGAGCCCAUAUUGAACCCUGCCCAUGAGCUUCAGGCCAUAGGGAGGGUGCACCGAAUUGGACAGACAAAACCUACUAUUGUACACAGAUUCUUAAUUAAAGCAACAAUAGAAGAAAGAAUGCAGGCAAUGCUGAAAACUGCUGAGAGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-692.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -739.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 915.22

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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