Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SNX13_0018300
Sequence Length
397 nt
GC Content
0.3854
GUCAAAAGAAAUAGACUGGCAACCUUAUUUUACUACACGCAUUGUAGAUGACUUUGGCACACACUUACGAGUAUUCAGAAAGGCUCAACAGAAAAUAACAGAGAAAGAUGAUCAAGUGAAAGGUACAGCAGAAGAUCUUGUAGAUACCUUCUUUGAAGUUGAAGUUGAAAUGGAGAAGGAGGUUUGCCGUGAUCUAGUGUGCACUUCCCCCAAAGAUGAAGAAGGAUUCCUAAGGGAUUUGUGUGAGGUCUUACUAUAUUUAUUGCUACCUCCUGGAGAUUUCCAGAACAAGAUCAUGCGAUACUUUGUCAGGGAAAUCCUUGCACGAGGAAUUCUUCUUCCAUUAAUAAAUCAACUCAGUGAUCCUGAUUAUAUUAAUCAGUAUGUCAUAUGGAUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -93.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 110.99
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((((((...((...))))))))).(((((.....)))))....((((((....(((((..((....(((......(((..............))).....)))))))))).((((((((.....(((((..((((..(((((((((...(((........)))...)))))))))))))...)))))..))))).)))...))))))..((((((((((((((........(((((((((((((........((((((....(((((((....))))).....))....))))))........))))...))))))))))))))))))))))).........))((.((..(((((.(((((((...)))))))...)))))..)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((........,.|,}{{,,..,,,|||,||.(((((.....))))).,,,(((((.......{{...((((.,,.......))))...,,.......}}))).....,..((({{.({{((((({.((((....,,}})).}.))))))}}}}}},(((({.,{{,.{{((((((((({,,.{{(|,(((((((.{{,,((({.{{{(,,..,(,,{{{.....|}}|||..)))}..,))}}(((((..,,.{{....}}.,}..)))))(((((....))))).}).)))))))))))..|{(((((((((....))))).))))))..))))))}})))))......))))))|,(((((.(((((((...)))))))...)))))..}}.})
Back