Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SNX29_0007300
Sequence Length
625 nt
GC Content
0.4992
GUCUGAACUCCAUACUCUUUGCGAUUAACAUCGACAACAAGGAUUUGAACGGGCAGAGUAAGUUUGCUCCCACCGUUUCAGACCUCUUAAAGGAGUCAACGCAGAACGUGACCUCCUUGCUGAAGGAGUCCACGCAAGGAGUGAGCAGCCUGUUCAGGGAGAUCACAGCCUCCUCUGCCGUCUCCAUCCUCAUCAAACCUGAACAGGAGACCGACCCCUUGCCUGUCGUGUCCAGGAAUGUCAGUGCUGAUGCCAAAUGCAAAAAGGAGCGGAAGAAGAAAAAGAAAGUGACCAACAUAAUCUCAUUUGAUGAUGAGGAAGAUGAGCAGAACUCUGGGGACGUGUUUAAAAAGACACCUGGGGCAGGGGAGAGCUCAGAGGACAACUCCGACCGCUCCUCUGUCAAUAUCAUGUCCGCCUUUGAAAGCCCCUUCGGGCCUAACUCCAAUGGAAGUCAGAGCAGCAACUCAUGGAAAAUUGAUUCCCUGUCUUUGAACGGGGAGUUUGGGUACCAGAAGCUUGAUGUGAAAAGCAUCGAUGAUGAAGAUGUGGAUGAAAACGAAGAUGACGUGUAUGGAAACUCAUCAGGAAGGAAGCACAGGGGCCACUCGGAGUCGCCCGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -198.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((..(.(((((((((((....((.((..((.(((((((((((((((...(((((....)))))...))).))))))(((.....))).((((.((.....)))))).)))))).))..)).))...))))))))))).)......))))))((((........))))((((((((((...(((((((((..(((....)))...(((.(.(((((((((.(((........))).))).))...(((.....)))..)))).)))).............((((((...........))))))..)))))))))))))).))))).......((((((((((....))))))....((((((((((.(.((.(((.....))).)).).))))))))))........))))(((((((...((.(((((..((((.(((((...)).))).)).))(((...((.(((......((((((((((......))))))))))......))))).)))((((((.....))))))...........((........))...(((((.((........)))))))..)))))..)).)))))))..(((((......)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,((({{({{(.(((((((((((.,..,,,{{..{,.,.(((.(((((((((...(((((....)))))...))))))))))))}.....{||{(((,,((.....)))))}{||||||,||,.}},}}.,,}))))))))||{|{,...,)))))|((((........))))((((((((((...(((((((((..(((....}}}...(((.{.{,{{{{,{{,|{{,|.,,|..,}}.}}}.}},,.|||.....))}..,,)).})))..........,,,..(((.....},,..}}),,}}},.)))))))))))))).))))}..,,.{{((((((((({....})))))....((((((((((.(.((.(((.....))).)).).))))))))))........)))){|{{{{{...((,({{{{||||((,(((((...}},.,||||{||{{,..,({,{{{......{{{{{{|||{,,,,,,}))))))))).},,}.))},,.},(((((((.....))))))},,,,,,...|||,,||,....}...{{{{{.{{.,.,....}})))))..}}}}}..}).)))))))..(((((......)))))..
Back