Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SNX29_0008600

Sequence Length

245 nt

GC Content

0.5959

GCCACUGGAAGGGAACACCUGCCUCUCCCAGAUGCACAGCUGGGCUCCGCUGAAGGUGCUGCACAAUGACUCCGACAUCCUCUUCCCUGUCAGUGGCGUGGGCUCCUACAGCCCAGCAGAUGCCCCCCUCGGAAGCCUGGAGAACGGGACAGGACCAGAGGACCACGUUCUCCCAGAUCCUGGACUUCGGUACAGUUCUGGAGGCUGAAAGACCAAGAUCAAGGUGCCAGCAGGGUUGAUUUCUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-78.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -82.89

Frequency: 0.0004

Diversity: 31.50

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((.(((((((((((((....(((((........)))))....))...)))))........................)))))).)))))))).((((((.....)))))).((((.((((..((.((..((((((((((((((..............)).))))))))..((((.(((.(((((((.((....))...)))).))).))).)))).)))).))))..)))).....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((({.(((((((((((((....(((((........)))))....))...))))).........|..............)))))).}))))))).((((((.....)))))).((((.,,,,((((,((..((((((((((((((.{.........,,.)).))))))))..((((.(((.(((((((.{,....,}...))))}}}).))).)))).)))).)),).})))......))))