Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SNX29_0008700
Sequence Length
312 nt
GC Content
0.6122
CUGGCCAGCGCCUGGACCUUCAUGCCCUGCCGCUCCUCCUGUUCAGCCACCUUCCUUUUCAAGGUGUCCACCUCUUGCCGGAGCGCGGCUGAGUGCUCCAUCUCACCGUCGAGCAGGUUUCGCAGUGAUCUGUUCUCCUCCUCCAGCUCAUCCUUCCUGUUCAUCAUGGCCACAGUGGCCUGGCGCAGUUCACCUGCUGGGCUGUAGGAGCCCACGCCACUGACAGGGAAGAGGAUGUCGGAGUCAUUGUGCAGCACCUUCAGCGGAGCCCAGCUGUGCAUCUGGGAGAGGCAGGUGUUCCCUUCCAGUGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-116.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -121.42
Frequency: 0.0002
Diversity: 74.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((....(((((.......((((((((.(((((..(((.((((((((((.......)))))).....(((..((((.....)))).)))(((((.((......)).)))))((((((((.(((..((((.(.....((((....(((((((((((((......(((((...)))))((((((((.....))))((((((.....)))))).))))..))))))...)))))))..)))).....).))))))).....))))))))..)))).)))...))))).)))))).)).....)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((....(((((.......((((((((.(((((..(((.((((((((((.......}))))).....,,,..,{{({{((((|||.|,)|||||}........,,.|||||(((({(((,{,{|,||||.|.....((((.,..(((((((((((({{,....(((({...}))))((((((((.....))))((((((.....)))))).)))).,))))))}..})))))).,)))).....),)}))}))}},..)}))))))..)))).)))...))))).)))))).)).....)))))))))
Back