Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SNX29_0018800
Sequence Length
1115 nt
GC Content
0.4798
AUCCUGGUACAUAGUAGAUGUUGACUUUUCUUCUUUGCCUGAGCUGGAUUAGGUGGGUGUAGGGGGAAUUCUUGUUCCAUACCAGAGUAAGCAUUUGUGGCCUGUUUCUGGCACAGGUACCUGAGUCAUUUUCCUGGACUUUUUGAACAAGGGAGAGCGUUUUUCUCCAUGGCCUCCAAGCCUCACUCCCCAGGCUACAGGUCCUUCCCUCUGUCUCUUCCUUGUAGGCCCCACCCCAUUUACAGGUCAUAUUCAUCACAUCUCCAGAACCCCUUCCUCUAGAUCAGGGGUGAGCAAACUGUGGCUUGUGGGCCACAUUGUCCCCUCGACAGUGUUUUUUUUUGUUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUCACUCUGACAGAGUCUCAGUCAUCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGACCUCAGCUCACUGCAACCCCUGCCUCCUGAGUUCAAGGGGUUCUCCUGCGUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGACUAUAGACAUCUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUGGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGAUCUUGAACUCCUGACCUGAAGUGAUCUACCCACCUCGGCCUCUCAAAGUGCUGGGAUUAUAGAAGUGAGCCACUGUGCCUGGCUGACAGUUUUUUUUUGUUUUUGAAUAAAGUUUUAUUGUAGUGCAGCCAUGUCCAUUCAUUAAUUUAAUGUCUGUGGCUGCUUUUAUACAACAAAGACAAAGGUGAGUCUUUAGGACAGAGCCCGUAUUAUCCACAAAGCCUAAAACAUUUAUCAUCUGGCUGGCUGCAGAAGACGUUUGCUGAGGCCUUAUCGAGAUGCCCCCGCUUCAGGGCUCCUGUAUGCUGAGCCGUCCUCCAUUCUACGCUGUUCAUUCUGUACACUGAGCAACUCUCCUGUGUGCAUCUCCCCAGGAGGCUGGGGCUCCCUGAGGGUAGGGCUCUCUCAUCCUAGGUGCCCACCUUGCUCACAACACAGGCACAUAGUAGGUGCUCAAUACCUAUGAAGUGAUAGAUGACUGGCUGGCUGAAUGAAUGAAAGAAUGAAAUAAACAUGAAAUAGUAAAUCAAGAUGGAGUUCUUCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-337.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -359.23
Frequency: 0.0000
Diversity: 384.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((...(((((.(..((....))..)))))).((((..((...(((((((((.((((((((..(((((((.....(((.((....(((((((.((.......))))))))))))))((((.........))))....)))))))((((((.....))))))..(((((...(((((........)))))..))))).))))))))(((((......).)))).......(((((.(((((((..((((..........((((((((((.(((..((.((((((((((((((..((((((....))))))((((((.....)))))).......)))))))............(((((...)))))(((((...))))).((((((.....))))))..(((((((((.........)).))))))))))))))..))..)))...)))))))))).....((((((((.((((((((((((.......................)))))))..)))))........((.((.((((.......)))).)).)).))))))))..))))....))))))))))))...)))))))))...)).))))..))))))))))(((((((((.((((((((.((.(((((((((((....(((((((....)))))))....)))))....)))))).)).))..(((((...)))))...)))))))))))))).....((((((........)))))).(((.(((((((((.((((.((...((((.....((((((((((..((((....(((((.....)))))...)))).....((((.((((...((((((((...........(((((.((............)).)))))...(((((((.(((.....)))..)))))))...((((((....))))))..))))))))...)))))))).....(((.(((((....(((....)))....))))).)))((((((.....))))))....))))))))))...))))...)).))))........(((.......)))................)))).))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((.(((({{.({....(((((....(((((((((({(((((,.(((...,((((((,{{((((((((,.{{{{|||,...{((({(.{{{.{((((({(((((,....||,}|||}}.,}}}||||......,}}),},....}}}}}}}((((((.....})))))..((({{...{|||{........))))),,))))},}),,))))|.{{{,,||},}.)})}))))))}|},||.)))||||,{{(({{.........((((((((((.(((..((.((((((({(((({,.,{(((((....)))))|{(((((.....)))))}},.....}}}}}}}...........,(((((...)))))|((({...))))}{{(((((.....)))))),.(((((((((.........)).))))))))))))))..))..)))...))))))))))...,.(((((((,.(((({(((((((......,......,.......},)))))))..}))))........{{.{{{{((({,..{{{||,|,||{||{||||||||,.,,,||,,,}},}}|}|}||},,,,,.,}}||||{|{{{.,,..)).)))))).|{,{||.,(({{{{||||{{||||||}||}}|,,.....{(((((((((.,,,,......,|((((..((((((((,..((({.(......,))))..})))))))).....))))}))))))))||||||.((,({{{|||,{{|{|||....{{{{{....((((.................)))}{{({{((({.....}))})}}.))))....,{,({.((((,.{{{{{,|((|,,,.,...,,{|||||{{..........,|||,|,|||...{((((((.(((,....}}},.))))))}...{{{|{|},},)}))))}.,,,}}|))||,))))}}},...,}}}))).))|))))}}|,},.,,...}})))))},}},||||}}}}}.}}}))))},,))),)))))},,}))))))))}},}}}}},)))))).))))..)))))....)}}}..}))).))|((,,....}})},.
Back