Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SOBP_0001000
Sequence Length
325 nt
GC Content
0.4369
AACUUUGCAGAAAACACCAUGAAUGAACUCCUUGGCUGGUAUGGCUAUGAUAAGGUUGAAUUAAAAGAUGGUGAGGAUAUUGAAUUCAGGAGCUACCCUACAGAUGGGGAGAGCCGGCAGCACAUUUCUGUUCUCAAAGAAAAUUCUUUGCCAAAACCAAAAUUACCCGAGGACAGUGUUAUUUCACCAUACAAUAUAAGCACAGGCUAUUCAGGGCUUGCCACUGGAAAUGGACUCAGUGACUCACCUGCAGGGUCAAAGGAUCAUGGCAGUGUGCCCAUUAUUGUACCUUUAAUUCCACCACCUUUCAUAAAGCCACCAGCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-81.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -87.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 52.37
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((..............)).........((((((..((((((((.(((((.((((((((..(((((((((((((((..(((.((.(((.(((((....)))))..))).(((((....(((((........))))).....))))).............)).)))..)))))))..))))))))((((((...(((((.(((((.((((....(.((((((........)))))).)...))))...((((....)))))))))..)))))....))))))...))))))))....)))))))))..))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......((..............)).........((((({.,((((((((.(((((.((((((((.{{((((((((((((((..(((.((.{((.(((((....))))).,}}),(((((....(((((........))))).....))))).............,}.)))..)))))))..)))))))|((((((...(((((,((({{.{,{||||,{,((((((........)))))).,...,||||.,|{||....)))),)})),,)))))....))))))..,)))))))).,..))))}))))..})))))))))..
Back