Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPTA1_0000900

Sequence Length

243 nt

GC Content

0.5514

GGAGAAGUUGAUACGAGUGAGCUCCCAGGACUAUGGGAGAGAUCUUCAGGGGGUUCAGAACUUGCUGAAGAAGCACAAACGCCUAGAGGGGGAGCUGGUGGCCCAUGAGCCUGCCAUCCAGAAUGUGCUGGAUAUGGCAGAGAAGCUGAAAGACAAGGCUGCUGUGGGGCAAGAGGAGAUCCAGUUGCGGCUGGCUCAGUUUGUUGAACACUGGGAGAAGCUCAAAGAGUUGGCCAAGGCCCG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-78.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -82.79

Frequency: 0.0013

Diversity: 60.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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