Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPTA1_0005100

Sequence Length

375 nt

GC Content

0.5040

AGGAAAUACCUGAAACACCAGACCUUUGCACAUGAAGUCGAUGGCCGAUCUGAGCAGGUGCAUGGCGUCAUCAACCUGGGGAACUCCCUGAUUGAGUGUAGCGCUUGUGAUGGCAAUGAAGAGGCCAUGAAGGAGCAACUGGAACAGCUGAAGGAACAUUGGGAUCAUCUGCUUGAGAGAACAAAUGACAAAGGGAAGAAGCUCAAUGAGGCCAGUCGUCAACAGAGGUUCAACACAAGCAUCCGGGACUUUGAGUUCUGGCUCUCAGAGGCAGAGACAUUGCUGGCCAUGAAAGAUCAGGCCAGGGACUUGGCUUCAGCAGGAAACCUACUCAAGAAGCAUCAGCUAUUGGAGAGAGAGAUGUUGGCUCGAGAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-102.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -109.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 80.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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