Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SPTA1_0006100
Sequence Length
295 nt
GC Content
0.4949
GUGGAAGGCUCUCAAAGCACAACUGAUUGAUGAGCGGACAAAGCUUGGAGACUAUGCCAACCUAAAACAAUUCUACCGAGACCUUGAGGAGCUGGAAGAAUGGAUCAGUGAGAUGCUGCCCACAGCCUGUGAUGAAUCCUACAAAGACGCCACUAACAUUCAGAGGAAAUACCUGAAACACCAGACCUUUGCACAUGAAGUCGAUGGCCGAUCUGAGCAGGUGCAUGGCGUCAUCAACCUGGGGAACUCCCUGAUUGAGUGUAGCGCUUGUGAUGGCAAUGAAGAGGCCAUGAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-70.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -76.76
Frequency: 0.0000
Diversity: 40.46
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((.((((....(((.((....))))).....)))).)))).....)).))((......(((((.(((...((....))...))).)))))((((..((.(.(.((((....)))).).).))..))))(((((.(.(((((((..((.((((.(((....(((.........(((((.(((((.((..((((.....)))).....)).))))).)).))).........)))...))))))).))))))..)))))))))(((((.........)))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..,{.((((.{(((....(((.{{....}}))).....)))}.)))),}...)),,)((......(((((.(({,{.((....))..}))).)))))((((..((.(.(.((((....)))).).).))..))))((({{{(.(((((({..((.((((.(((....(((.,.......(((((.(((((.((.,((((.....)))}},...)).))))).)).))).......,,))}...))))))).))))))..)))))))))(((((.........)))))..))
Back