Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_SPTA1_0007100
Sequence Length
289 nt
GC Content
0.5156
AGAAGCAGAUGACACGAAGGAGCAGAUUGAGAAGAAAUGCCAGGCCCUCAGUGCUGCAGACCCUGGCUCAGAUCUGUUCAGUGUUCAGGCUCUUCAGCGACGGCAUGAGGGCUUUGAAAGGGACCUCGUACCCCUGGGAGAUAAGAUGUUCCAGGGGAACUGUGAUCAAGUUGAGAGCUGGAUGGUGGCACGUGAGAAUUCCCUGAGGUCAGAUGACAAAAGUUCCUUAGACAGUCUGGAGGCUUUGAUGAAGAAACGGGACGAUUUGGACAAAGCAAUCACUGCCCAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-83.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -89.55
Frequency: 0.0001
Diversity: 64.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.((.((((((....(((((((((..((......((((((..((((....)).))..)))))))).))))))))).))).)))..))))))..(...(((((((..((((((..(((((.(((((.(((((((((.((...)).))))))))).))(((.((((((((...))))...)))).)))...)))...)))))...(((....)))......(((..(((..((((.(...((((...))))...).))))..))))))))))))..))).))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({(({{{.((((((....((((((((({{,.......((((((..((((....)).))..)))))))),))))))))).)))}|||.|}}|}}|.,{...(((((((..((((((..(((((.(((({.(((((((((.((...)).))))))))).}}(((.(((({(({...,)))...)))).))).,,)))...)))))...(((....)))......{((..{{,..((((.(...((((...})))...).))))..)},))}))))))..))).))))..}
Back