Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPTA1_0009700

Sequence Length

417 nt

GC Content

0.4868

ACUGUAGACAAGACUGCAACCAAAUUGAUUGGUGAUGACCAUUAUGAUUCAGAGAACAUCAAGGCUAUCCGUGACGGGGACUGGUGGAAGGUGGAAGCUGCUGAUCAUCAGGGCAUUGUCCCAGCUGUCUAUGUCAGAAGACUGGCCCACGAUGAGUUCCCGAUGCUCCCACAGCGGCGACGAGAAGAGCCAGGAAACAUCACCCAGCGCCAGGAGCAGAUUGAGAACCAAUACCGCUCCCUCUUGGAUCGGGCAGAAGAACGCAGACGUCGUCUAUUGCAACGUUAUAAUGAAUUUUUAUUGGCCUAUGAGGCAGGAGACAUGCUGGAAUGGAUUCAAGAGAAAAAGGCAGAAAACACUGGAGUGGAACUAGAUGAUGUUUGGGAGCUGCAGAAAAAGUUUGAUGAGUUCCAAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-112.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -117.93

Frequency: 0.0001

Diversity: 80.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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