Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPTA1_0014900

Sequence Length

848 nt

GC Content

0.4847

GGGAAAUAUCAGAAGCAUCAAUCCCUUGAAGCAGAGGUGCAAACAAAAUCAAGACUCAUGUCUGAACUGGAAAAAACAAGGGAAGAACGAUUUACCAUGGGUCAUUCUGCCCACGAAGAAACGAAGGCCCAUAUAGAGGAGCUACGCCACCUGUGGGACCUGCUGUUAGAGCUGACCCUGGAGAAGGGUGACCAGUUGCUGCGGGCCCUGAAGUUCCAGCAGUAUGUACAGGAGUGUGCUGACAUCUUAGAGUGGAUUGGAGACAAGGAGGCUAUAGCGACAUCAGUGGAGCUAGGUGAAGACUGGGAGCGCACCGAAGUUCUGCAUAAGAAAUUUGAAGACUUCCAAGUGGAGCUGGUAGCUAAAGAAGGGAGAGUUGUUGAAGUGAACCAAUAUGCCAAUGAGUGUGCCGAGGAAAACCAUCCUGACCUACCCUUAAUUCAGUCUAAGCAAAAUGAGGUGAAUGCUGCCUGGGAGCGCCUUCGUGGUUUGGCUCUCCAGAGACAGAAAGCUCUGUCCAAUGCUGCAAACUUACAACGAUUCAAAAGGGAUGUGACUGAAGCCAUCCAGUGGAUCAAGGAGAAGGAACCUGUACUCACCUCUGAGGACUAUGGCAAAGACCUUGUUGCCUCUGAAGGACUGUUUCACAGUCACAAGGGACUUGAGAGAAAUCUUGCUGUCAUGAGUGACAAGGUGAAGGAGUUAUGUGCUAAAGCAGAGAAGCUGACACUUUCCCAUCCUUCAGAUGCACCUCAGAUCCAGGAGAUGAAAGAAGAUCUGGUCUCCAGCUGGGAGCAUAUUCGUGCCCUGGCCACCAGCAGAUAUGAAAAACUGCAGGCUACUUAUUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-250.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -265.95

Frequency: 0.0000

Diversity: 183.84

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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