Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

BLAST PRIMER

Symbol

hsa_SPTA1_0015400

Sequence Length

563 nt

GC Content

0.4636

GUUCUAAACCUUUAGGAAAAAUGGAGCAAUUUCCAAAGGAAACCGUUGUGGAGAGCAGUGGGCCAAAGGUUUUGGAAACAGCAGAAGAGAUCCAGGAGAGGCGUCAGGAAGUGUUGACUCGGUAUCAAAGUUUCAAGGAGCGGGUCGCUGAGAGGGGUCAGAAGCUUGAGGAUUCCUAUCACUUACAAGUUUUCAAGCGAGAUGCAGAUGAUCUGGGGAAGUGGAUCAUGGAGAAAGUCAAUAUCUUAACCGAUAAGAGCUAUGAAGACCCAACUAAUAUACAGGAAAACCAUCCUGACCUACCCUUAAUUCAGUCUAAGCAAAAUGAGGUGAAUGCUGCCUGGGAGCGCCUUCGUGGUUUGGCUCUCCAGAGACAGAAAGCUCUGUCCAAUGCUGCAAACUUACAACGAUUCAAAAGGGAUGUGACUGAAGCCAUCCAGUGGAUCAAGGAGAAGGAACCUGUACUCACCUCUGAGGACUAUGGCAAAGACCUUGUUGCCUCUGAAGGACUGUUUCACAGUCACAAGGGACUUGAGAGAAAUCUUGCUGUCAUGAGUGACAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-150.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -162.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 114.93

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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