Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
hsa_TCF20_0002300
Sequence Length
310 nt
GC Content
0.4774
CAUGGCUCCCAGAAGUUACAAGAAUCCUGUUGGGAUCUUUCUCGGCAAACUUCUCCAGCCAAAAGCAGCGGUCCUCCAGGAAUGUCCAGUCAAAAAAGGUAUGGGCCGCCCCAUGAGACUGAUGGACAUGGACUAGCUGAGGCUACACAGUCAUCCAAACCUGGUAGUGUUAUGCUGAGACUUCCAGGCCAGGAGGAUCAUUCUUCUCAAAACCCCUUAAUCAUGAGGAGGCGUGUUCGUUCUUUUAUCUCUCCCAUUCCCAGUAAGAGACAGUCACAAGAUGUAAAGAACAGUAGCACUGAAGAUAAAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-87.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -92.00
Frequency: 0.0008
Diversity: 27.27
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((((...(((((((..........((((((((....)))))))))))))))..)))))...)(...((((((((.((.(((((((.(((.......((((((....))))))....))))))))))(((...((((.(....).))))..)))...(((((.(((.(((...))).))).))))))).))))))))..(((((......(((((((....))))).)).(((((((((((((((((((((.............)))).........)))).))))))).).))))).)))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((...(((((((..........((((((((....)))))))))))))))..)))))...)(...((((((((.((.{((((((,(((.......((((((....))))))....))))))))))(((...((((.{....}.))))..)))...(((((.(((.(({...})).))).))))))).))))))))..(((((......(((((((....))))).)).((((({(((((((((((((({..,,,....},..)))}........,)))).))))))).}.))))).)))))....)
Back